RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PTCH1Q13635 1447 aa21.01■□□□□ 0.95
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21■□□□□ 0.95
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21■□□□□ 0.95
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21■□□□□ 0.95
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 STRCQ7RTU9 1775 aa20.98■□□□□ 0.95
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYOM1P52179 1685 aa20.98■□□□□ 0.95
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADGRB2O60241 1585 aa20.94■□□□□ 0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NWD1Q149M9 1564 aa20.94■□□□□ 0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCNA6P17658 529 aa20.94■□□□□ 0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDK19Q9BWU1 502 aa20.92■□□□□ 0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANP32CO43423 234 aa20.91■□□□□ 0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.91■□□□□ 0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MIER1Q8N108 512 aa20.91■□□□□ 0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CABP2Q9NPB3 220 aa20.91■□□□□ 0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PANK3Q9H999 370 aa20.9■□□□□ 0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.88■□□□□ 0.93
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMC1Q8TDI8 760 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.84■□□□□ 0.93
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.83■□□□□ 0.93
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.83■□□□□ 0.93
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.83■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.8■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.8■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.8■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.8■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.79■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ITSN1Q15811 1721 aa20.79■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.78■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATP7BP35670 1465 aa20.78■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.78■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.78■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CABP1Q9NZU7 370 aa20.77■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.77■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.77■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 USP32Q8NFA0 1604 aa20.75■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C14orf37Q86TY3 774 aa20.75■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.75■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.75■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.75■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.74■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.74■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A0A1W2PP64 1363 aa20.73■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.73■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AKAP12Q02952 1782 aa20.73■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCER2I3L3R5 266 aa20.73■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RALBP1Q15311 655 aa20.73■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM94Q12767 1356 aa20.71■□□□□ 0.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.7■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUTM2FA1L443 756 aa20.7■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.7■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.7■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.7■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.69■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DCCP43146 1447 aa20.68■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.67■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NSD2O96028 1365 aa20.65■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ACEP12821 1306 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MSH6P52701 1360 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATF3P18847 181 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 USP6P35125 1406 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF1AQ12756 1690 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MORC1Q86VD1 984 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NLRP13Q86W25 1043 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FYB1O15117 783 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MST1RQ04912 1400 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms