RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432502.1

NUP50-AS1-202, humanhuman

TSL 2

Gene NUP50-AS1, Length 596 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ABCC11Q96J66 1382 aa28.95■■■□□ 2.22
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.94■■■□□ 2.22
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.91■■■□□ 2.22
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.91■■■□□ 2.22
NUP50-AS1-202ENST00000432502 STK26Q9P289 416 aa28.91■■■□□ 2.22
NUP50-AS1-202ENST00000432502 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.89■■■□□ 2.22
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MYOM2P54296 1465 aa28.89■■■□□ 2.22
NUP50-AS1-202ENST00000432502 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
NUP50-AS1-202ENST00000432502 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.84■■■□□ 2.21
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.83■■■□□ 2.21
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PXDNQ92626 1479 aa28.81■■■□□ 2.2
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.79■■■□□ 2.2
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 FOXO3O43524 673 aa28.75■■■□□ 2.19
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NUTM2FA1L443 756 aa28.74■■■□□ 2.19
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NGLY1Q96IV0 654 aa28.73■■■□□ 2.19
NUP50-AS1-202ENST00000432502 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KIF1AQ12756 1690 aa28.71■■■□□ 2.19
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DLC1Q96QB1 1528 aa28.71■■■□□ 2.19
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
NUP50-AS1-202ENST00000432502 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ADGRB1O14514 1584 aa28.7■■■□□ 2.18
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
NUP50-AS1-202ENST00000432502 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PRAM1Q96QH2 718 aa28.68■■■□□ 2.18
NUP50-AS1-202ENST00000432502 STAC3Q96MF2 364 aa28.66■■■□□ 2.18
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RGS12O14924 1447 aa28.66■■■□□ 2.18
NUP50-AS1-202ENST00000432502 USP21Q9UK80 565 aa28.64■■■□□ 2.18
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.63■■■□□ 2.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.63■■■□□ 2.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ADGRB2O60241 1585 aa28.62■■■□□ 2.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.61■■■□□ 2.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 POGKQ9P215 609 aa28.61■■■□□ 2.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.61■■■□□ 2.17
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.6■■■□□ 2.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.57■■■□□ 2.16
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.57■■■□□ 2.16
NUP50-AS1-202ENST00000432502 USP32Q8NFA0 1604 aa28.57■■■□□ 2.16
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 PSME1Q06323 249 aa28.54■■■□□ 2.16
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SBNO1A3KN83 1393 aa28.53■■■□□ 2.16
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
NUP50-AS1-202ENST00000432502 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SLIT2O94813 1529 aa28.48■■■□□ 2.15
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.47■■■□□ 2.15
NUP50-AS1-202ENST00000432502 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.46■■■□□ 2.15
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ARHGEF10O15013 1369 aa28.46■■■□□ 2.15
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.44■■■□□ 2.14
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.43■■■□□ 2.14
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ABCA3Q99758 1704 aa28.43■■■□□ 2.14
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.42■■■□□ 2.14
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.41■■■□□ 2.14
NUP50-AS1-202ENST00000432502 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.39■■■□□ 2.14
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.38■■■□□ 2.13
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ALS2Q96Q42 1657 aa28.38■■■□□ 2.13
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.37■■■□□ 2.13
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GLI3P10071 1580 aa28.37■■■□□ 2.13
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.36■■■□□ 2.13
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EP400Q96L91 3159 aa28.36■■■□□ 2.13
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ATP7BP35670 1465 aa28.35■■■□□ 2.13
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.35■■■□□ 2.13
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ITSN1Q15811 1721 aa28.33■■■□□ 2.13
NUP50-AS1-202ENST00000432502 VPS72Q15906 364 aa28.32■■■□□ 2.12
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PLEKHG5O94827 1062 aa28.31■■■□□ 2.12
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FAM83GA6ND36 823 aa28.3■■■□□ 2.12
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.3■■■□□ 2.12
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CDK19Q9BWU1 502 aa28.28■■■□□ 2.12
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.27■■■□□ 2.12
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.26■■■□□ 2.11
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CCDC125Q86Z20 511 aa28.25■■■□□ 2.11
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NRAPQ86VF7 1730 aa28.24■■■□□ 2.11
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