RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417936.5

SH3BP5-205, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-205ENST00000417936 LAMC1P11047 1609 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP5-205ENST00000417936 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BP5-205ENST00000417936 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP5-205ENST00000417936 TECPR2O15040 1411 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP5-205ENST00000417936 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BP5-205ENST00000417936 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP5-205ENST00000417936 NGLY1Q96IV0 654 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP5-205ENST00000417936 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
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SH3BP5-205ENST00000417936 ABCC11Q96J66 1382 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP5-205ENST00000417936 ADAMTS2O95450 1211 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP5-205ENST00000417936 STK26Q9P289 416 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP5-205ENST00000417936 PIK3C2GO75747 1445 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP5-205ENST00000417936 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP5-205ENST00000417936 SIRT1Q96EB6 747 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP5-205ENST00000417936 USP21Q9UK80 565 aa15.57■□□□□ 0.08
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SH3BP5-205ENST00000417936 RGS12O14924 1447 aa15.57■□□□□ 0.08
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SH3BP5-205ENST00000417936 PXDNQ92626 1479 aa15.55■□□□□ 0.08
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SH3BP5-205ENST00000417936 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP5-205ENST00000417936 NUTM2FA1L443 756 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP5-205ENST00000417936 KNDC1Q76NI1 1749 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP5-205ENST00000417936 IFT172Q9UG01 1749 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP5-205ENST00000417936 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP5-205ENST00000417936 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP5-205ENST00000417936 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP5-205ENST00000417936 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP5-205ENST00000417936 ATRNO75882 1429 aa15.51■□□□□ 0.07
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SH3BP5-205ENST00000417936 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP5-205ENST00000417936 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP5-205ENST00000417936 KIF1AQ12756 1690 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP5-205ENST00000417936 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP5-205ENST00000417936 STAC3Q96MF2 364 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP5-205ENST00000417936 PRAM1Q96QH2 718 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP5-205ENST00000417936 POGKQ9P215 609 aa15.48■□□□□ 0.07
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SH3BP5-205ENST00000417936 BCL9LQ86UU0 1499 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP5-205ENST00000417936 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.46■□□□□ 0.07
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SH3BP5-205ENST00000417936 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-205ENST00000417936 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-205ENST00000417936 DLC1Q96QB1 1528 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-205ENST00000417936 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-205ENST00000417936 SBNO1A3KN83 1393 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP5-205ENST00000417936 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
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SH3BP5-205ENST00000417936 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
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SH3BP5-205ENST00000417936 ARHGEF10O15013 1369 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP5-205ENST00000417936 CCDC125Q86Z20 511 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP5-205ENST00000417936 SLIT2O94813 1529 aa15.42■□□□□ 0.06
SH3BP5-205ENST00000417936 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP5-205ENST00000417936 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-205ENST00000417936 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-205ENST00000417936 ADGRB1O14514 1584 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-205ENST00000417936 ADGRB2O60241 1585 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP5-205ENST00000417936 USP32Q8NFA0 1604 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP5-205ENST00000417936 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP5-205ENST00000417936 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP5-205ENST00000417936 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.38■□□□□ 0.05
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SH3BP5-205ENST00000417936 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-205ENST00000417936 VPS72Q15906 364 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-205ENST00000417936 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.37■□□□□ 0.05
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SH3BP5-205ENST00000417936 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-205ENST00000417936 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-205ENST00000417936 TULP4Q9NRJ4 1543 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-205ENST00000417936 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-205ENST00000417936 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-205ENST00000417936 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-205ENST00000417936 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
SH3BP5-205ENST00000417936 PLEKHG5O94827 1062 aa15.33■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 GLI3P10071 1580 aa15.32■□□□□ 0.04
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SH3BP5-205ENST00000417936 SEPT12Q8IYM1 358 aa15.32■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 FAM83GA6ND36 823 aa15.31■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.31■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.31■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 A0A0G2JS52 829 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 MYT1Q01538 1121 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 BTG4Q9NY30 223 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP5-205ENST00000417936 EP400Q96L91 3159 aa15.28■□□□□ 0.04
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SH3BP5-205ENST00000417936 ATP7BP35670 1465 aa15.27■□□□□ 0.03
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