RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 MYOM2P54296 1465 aa39.56■■■■□ 3.92
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GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa39.55■■■■□ 3.92
GNPTAB-202ENST00000392919 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.54■■■■□ 3.92
GNPTAB-202ENST00000392919 CFAP70Q5T0N1 1121 aa39.53■■■■□ 3.92
GNPTAB-202ENST00000392919 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
GNPTAB-202ENST00000392919 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa39.51■■■■□ 3.92
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
GNPTAB-202ENST00000392919 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
GNPTAB-202ENST00000392919 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
GNPTAB-202ENST00000392919 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
GNPTAB-202ENST00000392919 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
GNPTAB-202ENST00000392919 LAMC1P11047 1609 aa39.47■■■■□ 3.91
GNPTAB-202ENST00000392919 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.44■■■■□ 3.9
GNPTAB-202ENST00000392919 PNPLA6Q8IY17 1366 aa39.44■■■■□ 3.9
GNPTAB-202ENST00000392919 NUTM2FA1L443 756 aa39.42■■■■□ 3.9
GNPTAB-202ENST00000392919 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
GNPTAB-202ENST00000392919 ESCO1Q5FWF5 840 aa39.4■■■■□ 3.9
GNPTAB-202ENST00000392919 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa39.4■■■■□ 3.9
GNPTAB-202ENST00000392919 DCAF11Q8TEB1 546 aa39.37■■■■□ 3.89
GNPTAB-202ENST00000392919 SIRT1Q96EB6 747 aa39.37■■■■□ 3.89
GNPTAB-202ENST00000392919 FMN2Q9NZ56 1722 aa39.34■■■■□ 3.89
GNPTAB-202ENST00000392919 NEUROD1Q13562 356 aa39.33■■■■□ 3.89
GNPTAB-202ENST00000392919 ADGRB1O14514 1584 aa39.32■■■■□ 3.88
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
GNPTAB-202ENST00000392919 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP39.3■■■■□ 3.88
GNPTAB-202ENST00000392919 PRAM1Q96QH2 718 aa39.3■■■■□ 3.88
GNPTAB-202ENST00000392919 FOXO3O43524 673 aa39.29■■■■□ 3.88
GNPTAB-202ENST00000392919 STAC3Q96MF2 364 aa39.29■■■■□ 3.88
GNPTAB-202ENST00000392919 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
GNPTAB-202ENST00000392919 NPHP3Q7Z494 1330 aa39.27■■■■□ 3.88
GNPTAB-202ENST00000392919 PXDNQ92626 1479 aa39.26■■■■□ 3.88
GNPTAB-202ENST00000392919 AFF2P51816 1311 aa39.26■■■■□ 3.88
GNPTAB-202ENST00000392919 DLC1Q96QB1 1528 aa39.24■■■■□ 3.87
GNPTAB-202ENST00000392919 C8orf37Q96NL8 207 aa39.23■■■■□ 3.87
GNPTAB-202ENST00000392919 ADAMTS2O95450 1211 aa39.22■■■■□ 3.87
GNPTAB-202ENST00000392919 TRAK1Q9UPV9 953 aa39.22■■■■□ 3.87
GNPTAB-202ENST00000392919 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
GNPTAB-202ENST00000392919 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.21■■■■□ 3.87
GNPTAB-202ENST00000392919 POGKQ9P215 609 aa39.21■■■■□ 3.87
GNPTAB-202ENST00000392919 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF1AQ12756 1690 aa39.15■■■■□ 3.86
GNPTAB-202ENST00000392919 NGLY1Q96IV0 654 aa39.12■■■■□ 3.85
GNPTAB-202ENST00000392919 RXRBP28702 533 aa39.11■■■■□ 3.85
GNPTAB-202ENST00000392919 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
GNPTAB-202ENST00000392919 PHF8Q9UPP1 1060 aa39.1■■■■□ 3.85
GNPTAB-202ENST00000392919 ADGRB2O60241 1585 aa39.09■■■■□ 3.85
GNPTAB-202ENST00000392919 USP32Q8NFA0 1604 aa39.09■■■■□ 3.85
GNPTAB-202ENST00000392919 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
GNPTAB-202ENST00000392919 KRT28Q7Z3Y7 464 aa39.07■■■■□ 3.85
GNPTAB-202ENST00000392919 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.07■■■■□ 3.84
GNPTAB-202ENST00000392919 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
GNPTAB-202ENST00000392919 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa39.05■■■■□ 3.84
GNPTAB-202ENST00000392919 TONSLQ96HA7 1378 aa39.03■■■■□ 3.84
GNPTAB-202ENST00000392919 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP39.02■■■■□ 3.84
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKARQ7Z5J8 1434 aa39.01■■■■□ 3.84
GNPTAB-202ENST00000392919 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa39■■■■□ 3.83
GNPTAB-202ENST00000392919 PRR36Q9H6K5 1346 aa38.98■■■■□ 3.83
GNPTAB-202ENST00000392919 USP21Q9UK80 565 aa38.98■■■■□ 3.83
GNPTAB-202ENST00000392919 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
GNPTAB-202ENST00000392919 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
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GNPTAB-202ENST00000392919 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
GNPTAB-202ENST00000392919 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
GNPTAB-202ENST00000392919 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa38.94■■■■□ 3.82
GNPTAB-202ENST00000392919 NBPF1Q3BBV0 1214 aa38.94■■■■□ 3.82
GNPTAB-202ENST00000392919 PSME1Q06323 249 aa38.93■■■■□ 3.82
GNPTAB-202ENST00000392919 TNS3Q68CZ2 1445 aa38.93■■■■□ 3.82
GNPTAB-202ENST00000392919 TULP4Q9NRJ4 1543 aa38.92■■■■□ 3.82
GNPTAB-202ENST00000392919 RGS12O14924 1447 aa38.91■■■■□ 3.82
GNPTAB-202ENST00000392919 NBPF8Q3BBV2 869 aa38.9■■■■□ 3.82
GNPTAB-202ENST00000392919 SBNO1A3KN83 1393 aa38.88■■■■□ 3.81
GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHG5O94827 1062 aa38.88■■■■□ 3.81
GNPTAB-202ENST00000392919 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
GNPTAB-202ENST00000392919 CABLES1Q8TDN4 633 aa38.87■■■■□ 3.81
GNPTAB-202ENST00000392919 BCL9LQ86UU0 1499 aa38.86■■■■□ 3.81
GNPTAB-202ENST00000392919 LMOD2Q6P5Q4 547 aa38.86■■■■□ 3.81
GNPTAB-202ENST00000392919 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
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GNPTAB-202ENST00000392919 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP38.84■■■■□ 3.81
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GNPTAB-202ENST00000392919 ATP7BP35670 1465 aa38.79■■■■□ 3.8
GNPTAB-202ENST00000392919 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa38.79■■■■□ 3.8
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCA3Q99758 1704 aa38.78■■■■□ 3.8
GNPTAB-202ENST00000392919 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
GNPTAB-202ENST00000392919 CDK19Q9BWU1 502 aa38.78■■■■□ 3.8
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGEF10O15013 1369 aa38.78■■■■□ 3.8
GNPTAB-202ENST00000392919 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
GNPTAB-202ENST00000392919 SLIT2O94813 1529 aa38.76■■■■□ 3.8
GNPTAB-202ENST00000392919 GPRASP1Q5JY77 1395 aa38.76■■■■□ 3.8
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GNPTAB-202ENST00000392919 ALS2Q96Q42 1657 aa38.74■■■■□ 3.79
GNPTAB-202ENST00000392919 ITSN1Q15811 1721 aa38.73■■■■□ 3.79
GNPTAB-202ENST00000392919 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
GNPTAB-202ENST00000392919 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
GNPTAB-202ENST00000392919 UNC5CLQ8IV45 518 aa38.7■■■■□ 3.79
GNPTAB-202ENST00000392919 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
GNPTAB-202ENST00000392919 RALGAPBQ86X10 1494 aa38.67■■■■□ 3.78
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