RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ARAP1Q96P48 1450 aa22.43■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 PDE3AQ14432 1141 aa22.43■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 NEK4P51957 841 aa22.42■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.42■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 PTPRGP23470 1445 aa22.42■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 MARCH6O60337 910 aa22.41■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 APPP05067 770 aa22.41■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 EVC2Q86UK5 1308 aa22.41■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 H0YHG0 523 aa22.41■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 SDF4Q9BRK5 362 aa22.41■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CALRP27797 417 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 MPNDQ8N594 471 aa22.4■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.39■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 SPC24Q8NBT2 197 aa22.39■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC27Q2M243 656 aa22.39■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 MCM2P49736 904 aa22.39■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CDR1P51861 262 aa22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 COG3Q96JB2 828 aa22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 FOSBP53539 338 aa22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 GNAI1P63096 354 aa22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 FIBPO43427 364 aa22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 PDILTQ8N807 584 aa22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 BCAR3O75815 825 aa22.34■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 NUTM2FA1L443 756 aa22.33■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 ERC2O15083 957 aa22.33■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CUX1P39880 1505 aa22.33■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.33■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.33■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 NCOA2Q15596 1464 aa22.33■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC184Q52MB2 194 aa22.32■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 NECTIN2Q92692 538 aa22.32■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.32■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 OLFM4Q6UX06 510 aa22.32■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.32■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 MIA2Q96PC5 1412 aa22.32■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 SYNJ1O43426 1573 aa22.31■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 SMC2O95347 1197 aa22.31■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 CCP110O43303 1012 aa22.31■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 KINO60870 393 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.31■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC192P0DO97 292 aa22.3■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 TRDNQ13061 729 aa22.3■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 PDCP20941 246 aa22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 NCAPD3P42695 1498 aa22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 TEFQ10587 303 aa22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 GCC1Q96CN9 775 aa22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 PPP2R1AP30153 589 aa22.28■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.28■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.28■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 PSMA5P28066 241 aa22.27■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.27■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 VPS53Q5VIR6 699 aa22.27■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 CAGE1Q8TC20 777 aa22.26■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 TAF3Q5VWG9 929 aa22.26■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.26■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.25■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.25■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.24■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.24■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 DCTN1Q14203 1278 aa22.24■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.24■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 CNTROBQ8N137 903 aa22.23■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 HMOX1P09601 288 aa22.22■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 MTHFSP49914 203 aa22.22■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.22■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.22■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 PRXQ9BXM0 1461 aa22.21■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
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