RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 SLC24A1O60721 1099 aa24.56■■□□□ 1.52
LTV1-201ENST00000367576 MYOM1P52179 1685 aa24.56■■□□□ 1.52
LTV1-201ENST00000367576 PIK3R4Q99570 1358 aa24.55■■□□□ 1.52
LTV1-201ENST00000367576 KCNA6P17658 529 aa24.54■■□□□ 1.52
LTV1-201ENST00000367576 CABP2Q9NPB3 220 aa24.54■■□□□ 1.52
LTV1-201ENST00000367576 SIRT1Q96EB6 747 aa24.53■■□□□ 1.52
LTV1-201ENST00000367576 PTCH1Q13635 1447 aa24.53■■□□□ 1.52
LTV1-201ENST00000367576 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
LTV1-201ENST00000367576 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
LTV1-201ENST00000367576 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
LTV1-201ENST00000367576 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
LTV1-201ENST00000367576 STRCQ7RTU9 1775 aa24.49■■□□□ 1.51
LTV1-201ENST00000367576 CDK19Q9BWU1 502 aa24.49■■□□□ 1.51
LTV1-201ENST00000367576 PANK3Q9H999 370 aa24.49■■□□□ 1.51
LTV1-201ENST00000367576 ANP32CO43423 234 aa24.48■■□□□ 1.51
LTV1-201ENST00000367576 TMC1Q8TDI8 760 aa24.47■■□□□ 1.51
LTV1-201ENST00000367576 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
LTV1-201ENST00000367576 NWD1Q149M9 1564 aa24.44■■□□□ 1.5
LTV1-201ENST00000367576 ADGRB2O60241 1585 aa24.44■■□□□ 1.5
LTV1-201ENST00000367576 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
LTV1-201ENST00000367576 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.43■■□□□ 1.5
LTV1-201ENST00000367576 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.41■■□□□ 1.5
LTV1-201ENST00000367576 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
LTV1-201ENST00000367576 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.38■■□□□ 1.49
LTV1-201ENST00000367576 NUTM2FA1L443 756 aa24.38■■□□□ 1.49
LTV1-201ENST00000367576 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
LTV1-201ENST00000367576 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.36■■□□□ 1.49
LTV1-201ENST00000367576 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
LTV1-201ENST00000367576 ATP7BP35670 1465 aa24.34■■□□□ 1.49
LTV1-201ENST00000367576 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.34■■□□□ 1.49
LTV1-201ENST00000367576 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
LTV1-201ENST00000367576 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
LTV1-201ENST00000367576 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
LTV1-201ENST00000367576 C14orf37Q86TY3 774 aa24.33■■□□□ 1.49
LTV1-201ENST00000367576 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.33■■□□□ 1.49
LTV1-201ENST00000367576 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.33■■□□□ 1.49
LTV1-201ENST00000367576 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 CABP1Q9NZU7 370 aa24.33■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.32■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.32■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.32■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.31■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.31■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 A0A1W2PP64 1363 aa24.31■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.29■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 USP32Q8NFA0 1604 aa24.29■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.29■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.28■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.28■■□□□ 1.48
LTV1-201ENST00000367576 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.26■■□□□ 1.47
LTV1-201ENST00000367576 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.26■■□□□ 1.47
LTV1-201ENST00000367576 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
LTV1-201ENST00000367576 TMEM94Q12767 1356 aa24.25■■□□□ 1.47
LTV1-201ENST00000367576 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
LTV1-201ENST00000367576 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
LTV1-201ENST00000367576 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.22■■□□□ 1.47
LTV1-201ENST00000367576 CCER2I3L3R5 266 aa24.21■■□□□ 1.47
LTV1-201ENST00000367576 ITSN1Q15811 1721 aa24.21■■□□□ 1.47
LTV1-201ENST00000367576 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.21■■□□□ 1.47
LTV1-201ENST00000367576 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.2■■□□□ 1.47
LTV1-201ENST00000367576 CCDC184Q52MB2 194 aa24.2■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 RALBP1Q15311 655 aa24.19■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.19■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.17■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.17■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 AKAP12Q02952 1782 aa24.17■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 ACEP12821 1306 aa24.17■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.16■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.461e-6■■■□□ 17.7
LTV1-201ENST00000367576 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.16■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.14■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.14■■□□□ 1.46
LTV1-201ENST00000367576 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 MRS2Q9HD23 443 aa24.14■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.12■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.12■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.11■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 MSH6P52701 1360 aa24.11■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 ATF3P18847 181 aa24.1■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.1■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 MORC1Q86VD1 984 aa24.1■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.1■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 USP6P35125 1406 aa24.09■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.09■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 NSD2O96028 1365 aa24.09■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 FYB1O15117 783 aa24.08■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 DCCP43146 1447 aa24.08■■□□□ 1.45
LTV1-201ENST00000367576 PPP2R1AP30153 589 aa24.07■■□□□ 1.44
LTV1-201ENST00000367576 NME9Q86XW9 330 aa24.07■■□□□ 1.44
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