RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 CDCA8Q53HL2 280 aa27.29■■□□□ 1.96
OPN3-201ENST00000366554 HS1BP3Q53T59 392 aa27.26■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.26■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.24■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.21■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 MYOM1P52179 1685 aa27.21■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 KLHL40Q2TBA0 621 aa27.2■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 CLEC17AQ6ZS10 378 aa27.2■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 IQGAP1P46940 1657 aa27.2■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 GRIN2AQ12879 1464 aa27.2■■□□□ 1.95
OPN3-201ENST00000366554 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
OPN3-201ENST00000366554 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
OPN3-201ENST00000366554 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
OPN3-201ENST00000366554 SHROOM2Q13796 1616 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-201ENST00000366554 UQCRHLA0A096LP55 91 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-201ENST00000366554 UQCRHP07919 91 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-201ENST00000366554 ATP10AO60312 1499 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-201ENST00000366554 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
OPN3-201ENST00000366554 PDLIM2Q96JY6 352 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-201ENST00000366554 ZNF445P59923 1031 aa27.15■■□□□ 1.94
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OPN3-201ENST00000366554 KIF2CQ99661 725 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-201ENST00000366554 DYNC1I1O14576 645 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-201ENST00000366554 UNC13BO14795 1591 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-201ENST00000366554 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-201ENST00000366554 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 GOLGA6L22H0YM25 854 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 KANK1Q14678 1352 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 SSFA2P28290 1259 aa27.12■■□□□ 1.93
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OPN3-201ENST00000366554 NEUROD2Q15784 382 aa27.12■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.11■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.1■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.1■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 RUNDC1Q96C34 613 aa27.1■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 BAG4O95429 457 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
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OPN3-201ENST00000366554 MADDQ8WXG6 1647 aa27.08■■□□□ 1.93
OPN3-201ENST00000366554 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.07■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
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OPN3-201ENST00000366554 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.07■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa27.07■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 CCDC27Q2M243 656 aa27.05■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 MCM5P33992 734 aa27.05■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 RBSNQ9H1K0 784 aa27.04■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa27.03■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.03■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 SHPRHQ149N8 1683 aa27.03■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 DMTNQ08495 405 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 SASS6Q6UVJ0 657 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
OPN3-201ENST00000366554 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.01■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 NUCB1Q02818 461 aa27.01■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 PRDM10Q9NQV6 1147 aa27■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 CEP152O94986 1710 aa26.99■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 TRIM27P14373 513 aa26.99■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 ARID3AQ99856 593 aa26.99■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 FGD1P98174 961 aa26.99■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.98■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 ABCA8O94911 1581 aa26.98■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.98■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 LMBRD1Q9NUN5 540 aa26.97■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.95■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
OPN3-201ENST00000366554 ATP10BO94823 1461 aa26.95■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.95■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 MCTP1Q6DN14 999 aa26.94■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 LNPKQ9C0E8 428 aa26.94■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.94■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.93■■□□□ 1.9
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