RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXA4-201ENST00000360046 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
HOXA4-201ENST00000360046 SIRT1Q96EB6 747 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXA4-201ENST00000360046 KCNA6P17658 529 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXA4-201ENST00000360046 PTCH1Q13635 1447 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXA4-201ENST00000360046 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXA4-201ENST00000360046 EVC2Q86UK5 1308 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXA4-201ENST00000360046 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXA4-201ENST00000360046 NWD1Q149M9 1564 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXA4-201ENST00000360046 MYOM1P52179 1685 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXA4-201ENST00000360046 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
HOXA4-201ENST00000360046 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
HOXA4-201ENST00000360046 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
HOXA4-201ENST00000360046 CABP2Q9NPB3 220 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXA4-201ENST00000360046 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
HOXA4-201ENST00000360046 CDK19Q9BWU1 502 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXA4-201ENST00000360046 ADGRB2O60241 1585 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
HOXA4-201ENST00000360046 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
HOXA4-201ENST00000360046 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
HOXA4-201ENST00000360046 C14orf37Q86TY3 774 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXA4-201ENST00000360046 TMC1Q8TDI8 760 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXA4-201ENST00000360046 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXA4-201ENST00000360046 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
HOXA4-201ENST00000360046 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.11■■■□□ 2.41
HOXA4-201ENST00000360046 PANK3Q9H999 370 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXA4-201ENST00000360046 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXA4-201ENST00000360046 MIER1Q8N108 512 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXA4-201ENST00000360046 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXA4-201ENST00000360046 ANP32CO43423 234 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM94Q12767 1356 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXA4-201ENST00000360046 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXA4-201ENST00000360046 NUTM2FA1L443 756 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXA4-201ENST00000360046 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXA4-201ENST00000360046 ATP7BP35670 1465 aa30■■■□□ 2.39
HOXA4-201ENST00000360046 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
HOXA4-201ENST00000360046 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30■■■□□ 2.39
HOXA4-201ENST00000360046 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.98■■■□□ 2.39
HOXA4-201ENST00000360046 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
HOXA4-201ENST00000360046 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXA4-201ENST00000360046 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXA4-201ENST00000360046 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
HOXA4-201ENST00000360046 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXA4-201ENST00000360046 CABP1Q9NZU7 370 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXA4-201ENST00000360046 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXA4-201ENST00000360046 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.95■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.95■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 USP32Q8NFA0 1604 aa29.95■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 ITSN1Q15811 1721 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 A0A1W2PP64 1363 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 ATF3P18847 181 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 MSH6P52701 1360 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
HOXA4-201ENST00000360046 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
HOXA4-201ENST00000360046 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
HOXA4-201ENST00000360046 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
HOXA4-201ENST00000360046 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXA4-201ENST00000360046 AKAP12Q02952 1782 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXA4-201ENST00000360046 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
HOXA4-201ENST00000360046 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXA4-201ENST00000360046 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXA4-201ENST00000360046 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
HOXA4-201ENST00000360046 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXA4-201ENST00000360046 DCCP43146 1447 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXA4-201ENST00000360046 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXA4-201ENST00000360046 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXA4-201ENST00000360046 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXA4-201ENST00000360046 ACEP12821 1306 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXA4-201ENST00000360046 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXA4-201ENST00000360046 RALBP1Q15311 655 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXA4-201ENST00000360046 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXA4-201ENST00000360046 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
HOXA4-201ENST00000360046 ORAI2Q96SN7 254 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
HOXA4-201ENST00000360046 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXA4-201ENST00000360046 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
HOXA4-201ENST00000360046 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXA4-201ENST00000360046 MST1RQ04912 1400 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXA4-201ENST00000360046 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXA4-201ENST00000360046 CCER2I3L3R5 266 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXA4-201ENST00000360046 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
HOXA4-201ENST00000360046 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.72■■■□□ 2.35
HOXA4-201ENST00000360046 NSD2O96028 1365 aa29.7■■■□□ 2.35
HOXA4-201ENST00000360046 USP6P35125 1406 aa29.7■■■□□ 2.35
HOXA4-201ENST00000360046 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.7■■■□□ 2.34
HOXA4-201ENST00000360046 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
HOXA4-201ENST00000360046 SLAIN2Q9P270 581 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXA4-201ENST00000360046 KIF1AQ12756 1690 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXA4-201ENST00000360046 MORC1Q86VD1 984 aa29.65■■■□□ 2.34
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