RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SNX11-201ENST00000359238 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.86■■□□□ 1.57
SNX11-201ENST00000359238 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.86■■□□□ 1.57
SNX11-201ENST00000359238 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SNX11-201ENST00000359238 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.85■■□□□ 1.57
SNX11-201ENST00000359238 LTKP29376 864 aa24.84■■□□□ 1.57
SNX11-201ENST00000359238 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SNX11-201ENST00000359238 SLC24A1O60721 1099 aa24.83■■□□□ 1.57
SNX11-201ENST00000359238 NLRP13Q86W25 1043 aa24.83■■□□□ 1.57
SNX11-201ENST00000359238 PRAM1Q96QH2 718 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX11-201ENST00000359238 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SNX11-201ENST00000359238 CABP2Q9NPB3 220 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX11-201ENST00000359238 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX11-201ENST00000359238 METP08581 1390 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX11-201ENST00000359238 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX11-201ENST00000359238 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SNX11-201ENST00000359238 POGKQ9P215 609 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX11-201ENST00000359238 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.78■■□□□ 1.56
SNX11-201ENST00000359238 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX11-201ENST00000359238 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX11-201ENST00000359238 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.77■■□□□ 1.56
SNX11-201ENST00000359238 PPP2R1AP30153 589 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX11-201ENST00000359238 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SNX11-201ENST00000359238 NBR1Q14596 966 aa24.75■■□□□ 1.55
SNX11-201ENST00000359238 EID1Q9Y6B2 187 aa24.75■■□□□ 1.55
SNX11-201ENST00000359238 EVC2Q86UK5 1308 aa24.74■■□□□ 1.55
SNX11-201ENST00000359238 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SNX11-201ENST00000359238 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.73■■□□□ 1.55
SNX11-201ENST00000359238 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.73■■□□□ 1.55
SNX11-201ENST00000359238 SLIT1O75093 1534 aa24.73■■□□□ 1.55
SNX11-201ENST00000359238 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.72■■□□□ 1.55
SNX11-201ENST00000359238 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SNX11-201ENST00000359238 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.72■■□□□ 1.55
SNX11-201ENST00000359238 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.72■■□□□ 1.55
SNX11-201ENST00000359238 ABCC11Q96J66 1382 aa24.7■■□□□ 1.54
SNX11-201ENST00000359238 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SNX11-201ENST00000359238 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SNX11-201ENST00000359238 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SNX11-201ENST00000359238 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.67■■□□□ 1.54
SNX11-201ENST00000359238 DLC1Q96QB1 1528 aa24.67■■□□□ 1.54
SNX11-201ENST00000359238 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SNX11-201ENST00000359238 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SNX11-201ENST00000359238 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX11-201ENST00000359238 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SNX11-201ENST00000359238 CDK19Q9BWU1 502 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX11-201ENST00000359238 A0A1W2PP64 1363 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX11-201ENST00000359238 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SNX11-201ENST00000359238 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX11-201ENST00000359238 MED14O60244 1454 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX11-201ENST00000359238 TECPR2O15040 1411 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX11-201ENST00000359238 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX11-201ENST00000359238 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX11-201ENST00000359238 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SNX11-201ENST00000359238 PTPRUQ92729 1446 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX11-201ENST00000359238 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.58■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 CPS1P31327 1500 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 USP32Q8NFA0 1604 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 TBX22Q9Y458 520 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 CABP1Q9NZU7 370 aa24.55■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 MORC1Q86VD1 984 aa24.53■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 SIRT1Q96EB6 747 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SNX11-201ENST00000359238 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SNX11-201ENST00000359238 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.51■■□□□ 1.51
SNX11-201ENST00000359238 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.51■■□□□ 1.51
SNX11-201ENST00000359238 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SNX11-201ENST00000359238 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX11-201ENST00000359238 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX11-201ENST00000359238 NUDCQ9Y266 331 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX11-201ENST00000359238 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX11-201ENST00000359238 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX11-201ENST00000359238 DIP2AQ14689 1571 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX11-201ENST00000359238 SHPRHQ149N8 1683 aa24.48■■□□□ 1.51
SNX11-201ENST00000359238 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
SNX11-201ENST00000359238 FYB1O15117 783 aa24.45■■□□□ 1.51
SNX11-201ENST00000359238 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.45■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.45■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 KCNA6P17658 529 aa24.44■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 MTHFSP49914 203 aa24.44■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.44■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 NUTM2FA1L443 756 aa24.44■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 FBLN1P23142 703 aa24.44■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 IL27Q8NEV9 243 aa24.44■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 PTCH1Q13635 1447 aa24.43■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.41■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 INSRP06213 1382 aa24.4■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
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