RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340305.9

TMEM201-201, Transcript of transmembrane protein 201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM201, Length 3,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201-201ENST00000340305 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 SHANK2Q9UPX8 1470 aa17.38■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 RBM10P98175 930 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 INSRP06213 1382 aa17.37■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 ADCY10Q96PN6 1610 aa17.37■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 PIK3C2GO75747 1445 aa17.37■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 FSD2A1L4K1 749 aa17.37■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 DDX11L8A8MPP1 907 aa17.36■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 APBB1O00213 710 aa17.36■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 ANKRD45Q5TZF3 282 aa17.36■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 IFT140Q96RY7 1462 aa17.36■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 SSH1Q8WYL5 1049 aa17.36■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 TRIM27P14373 513 aa17.35■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 TMEM57Q8N5G2 664 aa17.35■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 NSD3Q9BZ95 1437 aa17.35■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 NLRP1Q9C000 1473 aa17.34■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
TMEM201-201ENST00000340305 STK26Q9P289 416 aa17.33■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 ERCC6Q03468 1493 aa17.33■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 GBP4Q96PP9 640 aa17.33■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 SYNJ2O15056 1496 aa17.32■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 SSFA2P28290 1259 aa17.32■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 GGNBP2Q9H3C7 697 aa17.32■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa17.31■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.3■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 CABP2Q9NPB3 220 aa17.3■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa17.29■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 DDX19BQ9UMR2 479 aa17.28■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 WDR63Q8IWG1 891 aa17.28■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 FBLN1P23142 703 aa17.28■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa17.27■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 MPNDQ8N594 471 aa17.27■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 NASPP49321 788 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 FAM13BQ9NYF5 915 aa17.27■□□□□ 0.36
TMEM201-201ENST00000340305 MSNP26038 577 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 RIPK4P57078 832 aa17.27■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 MCTP1Q6DN14 999 aa17.27■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 NINLQ9Y2I6 1382 aa17.27■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 GOLGA6L22H0YM25 854 aa17.26■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 NUP160Q12769 1436 aa17.26■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 CHAMP1Q96JM3 812 aa17.26■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 MYO5CQ9NQX4 1742 aa17.25■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 RRP9O43818 475 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 GGT6Q6P531 493 aa17.24■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 NGEFQ8N5V2 710 aa17.24■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 GAS2L2Q8NHY3 880 aa17.24■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 ABCC2Q92887 1545 aa17.23■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 CHD1LQ86WJ1 897 aa17.23■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 ABCA8O94911 1581 aa17.22■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.21■□□□□ 0.35
TMEM201-201ENST00000340305 RNF214Q8ND24 703 aa17.2■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 HMOX1P09601 288 aa17.2■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 ERVK-7P63135 1459 aa17.2■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa17.19■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 KANK1Q14678 1352 aa17.19■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 ARHGEF5Q12774 1597 aa17.19■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 UGGT1Q9NYU2 1555 aa17.18■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 SYNMO15061 1565 aa17.18■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 RAB3GAP1Q15042 981 aa17.18■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 SMC5Q8IY18 1101 aa17.18■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 AAMPQ13685 434 aa17.17■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 PKP1Q13835 747 aa17.17■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa17.17■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa17.17■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa17.16■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 NUCB1Q02818 461 aa17.16■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.16■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 ATAD2Q6PL18 1390 aa17.16■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 BAG4O95429 457 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.15■□□□□ 0.34
TMEM201-201ENST00000340305 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms