RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
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LRRC25-201ENST00000339007 CHD1O14646 1710 aa23.39■■□□□ 1.34
LRRC25-201ENST00000339007 MORC1Q86VD1 984 aa23.39■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.39■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 AFAP1Q8N556 730 aa23.39■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
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LRRC25-201ENST00000339007 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.38■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.38■■□□□ 1.33
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LRRC25-201ENST00000339007 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.35■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 TNNQ9UQP3 1299 aa23.34■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.34■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC27Q2M243 656 aa23.33■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 KIF1BO60333 1816 aa23.33■■□□□ 1.33
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LRRC25-201ENST00000339007 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.33■■□□□ 1.33
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LRRC25-201ENST00000339007 IFT172Q9UG01 1749 aa23.32■■□□□ 1.32
LRRC25-201ENST00000339007 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.31■■□□□ 1.32
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LRRC25-201ENST00000339007 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.3■■□□□ 1.32
LRRC25-201ENST00000339007 ATP7AQ04656 1500 aa23.3■■□□□ 1.32
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LRRC25-201ENST00000339007 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.28■■□□□ 1.32
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LRRC25-201ENST00000339007 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.27■■□□□ 1.32
LRRC25-201ENST00000339007 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.27■■□□□ 1.31
LRRC25-201ENST00000339007 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.27■■□□□ 1.31
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LRRC25-201ENST00000339007 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.26■■□□□ 1.31
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LRRC25-201ENST00000339007 USP32Q8NFA0 1604 aa23.25■■□□□ 1.31
LRRC25-201ENST00000339007 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.25■■□□□ 1.31
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LRRC25-201ENST00000339007 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
LRRC25-201ENST00000339007 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.24■■□□□ 1.31
LRRC25-201ENST00000339007 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.24■■□□□ 1.31
LRRC25-201ENST00000339007 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.24■■□□□ 1.31
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LRRC25-201ENST00000339007 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.22■■□□□ 1.31
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LRRC25-201ENST00000339007 NOS1P29475 1434 aa23.21■■□□□ 1.31
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LRRC25-201ENST00000339007 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
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LRRC25-201ENST00000339007 ADGRB2O60241 1585 aa23.18■■□□□ 1.3
LRRC25-201ENST00000339007 ADGRB3O60242 1522 aa23.18■■□□□ 1.3
LRRC25-201ENST00000339007 TRAK2O60296 914 aa23.17■■□□□ 1.3
LRRC25-201ENST00000339007 FANCAO15360 1455 aa23.17■■□□□ 1.3
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LRRC25-201ENST00000339007 HSCBQ8IWL3 235 aa23.15■■□□□ 1.3
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LRRC25-201ENST00000339007 MRE11P49959 708 aa23.12■■□□□ 1.29
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LRRC25-201ENST00000339007 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.12■■□□□ 1.29
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LRRC25-201ENST00000339007 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC25-201ENST00000339007 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
LRRC25-201ENST00000339007 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
LRRC25-201ENST00000339007 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
LRRC25-201ENST00000339007 EVC2Q86UK5 1308 aa23.08■■□□□ 1.28
LRRC25-201ENST00000339007 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
LRRC25-201ENST00000339007 CD109Q6YHK3 1445 aa23.06■■□□□ 1.28
LRRC25-201ENST00000339007 ABCC11Q96J66 1382 aa23.06■■□□□ 1.28
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