RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa36.1■■■■□ 3.37
HOXD8-201ENST00000313173 POGKQ9P215 609 aa36.1■■■■□ 3.37
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HOXD8-201ENST00000313173 ABCC11Q96J66 1382 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXD8-201ENST00000313173 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXD8-201ENST00000313173 CABP2Q9NPB3 220 aa36.04■■■■□ 3.36
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa36.03■■■■□ 3.36
HOXD8-201ENST00000313173 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
HOXD8-201ENST00000313173 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.02■■■■□ 3.36
HOXD8-201ENST00000313173 NEFLP07196 543 aa36.01■■■■□ 3.36
HOXD8-201ENST00000313173 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.01■■■■□ 3.35
HOXD8-201ENST00000313173 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
HOXD8-201ENST00000313173 METP08581 1390 aa36■■■■□ 3.35
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HOXD8-201ENST00000313173 TECPR2O15040 1411 aa35.95■■■■□ 3.35
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HOXD8-201ENST00000313173 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.34
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HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXD8-201ENST00000313173 LTKP29376 864 aa35.93■■■■□ 3.34
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HOXD8-201ENST00000313173 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
HOXD8-201ENST00000313173 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.92■■■■□ 3.34
HOXD8-201ENST00000313173 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.91■■■■□ 3.34
HOXD8-201ENST00000313173 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.9■■■■□ 3.34
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HOXD8-201ENST00000313173 NSD2O96028 1365 aa35.89■■■■□ 3.34
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HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PP64 1363 aa35.87■■■■□ 3.33
HOXD8-201ENST00000313173 EID1Q9Y6B2 187 aa35.87■■■■□ 3.33
HOXD8-201ENST00000313173 NUDCQ9Y266 331 aa35.86■■■■□ 3.33
HOXD8-201ENST00000313173 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP35.85■■■■□ 3.33
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HOXD8-201ENST00000313173 MED14O60244 1454 aa35.83■■■■□ 3.33
HOXD8-201ENST00000313173 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.83■■■■□ 3.33
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HOXD8-201ENST00000313173 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa35.82■■■■□ 3.32
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HOXD8-201ENST00000313173 ATP7BP35670 1465 aa35.75■■■■□ 3.31
HOXD8-201ENST00000313173 PDE3BQ13370 1112 aa35.75■■■■□ 3.31
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa35.74■■■■□ 3.31
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HOXD8-201ENST00000313173 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
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HOXD8-201ENST00000313173 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.72■■■■□ 3.31
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HOXD8-201ENST00000313173 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.69■■■■□ 3.3
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HOXD8-201ENST00000313173 PTPRUQ92729 1446 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXD8-201ENST00000313173 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXD8-201ENST00000313173 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.65■■■■□ 3.3
HOXD8-201ENST00000313173 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
HOXD8-201ENST00000313173 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.62■■■■□ 3.29
HOXD8-201ENST00000313173 ERICH6BQ5W0A0 696 aa35.61■■■■□ 3.29
HOXD8-201ENST00000313173 FYB1O15117 783 aa35.6■■■■□ 3.29
HOXD8-201ENST00000313173 MTHFSP49914 203 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXD8-201ENST00000313173 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
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HOXD8-201ENST00000313173 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXD8-201ENST00000313173 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXD8-201ENST00000313173 RNF123Q5XPI4 1314 aa35.58■■■■□ 3.29
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HOXD8-201ENST00000313173 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.29
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HOXD8-201ENST00000313173 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.54■■■■□ 3.28
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HOXD8-201ENST00000313173 AKAP12Q02952 1782 aa35.52■■■■□ 3.28
HOXD8-201ENST00000313173 ITSN1Q15811 1721 aa35.52■■■■□ 3.28
HOXD8-201ENST00000313173 CDCA7LQ96GN5 454 aa35.51■■■■□ 3.28
HOXD8-201ENST00000313173 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.51■■■■□ 3.27
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF521Q96K83 1311 aa35.51■■■■□ 3.27
HOXD8-201ENST00000313173 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.49■■■■□ 3.27
HOXD8-201ENST00000313173 PIK3R4Q99570 1358 aa35.49■■■■□ 3.27
HOXD8-201ENST00000313173 NGEFQ8N5V2 710 aa35.47■■■■□ 3.27
HOXD8-201ENST00000313173 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.46■■■■□ 3.27
HOXD8-201ENST00000313173 APAF1O14727 1248 aa35.45■■■■□ 3.27
HOXD8-201ENST00000313173 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.44■■■■□ 3.26
HOXD8-201ENST00000313173 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
HOXD8-201ENST00000313173 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
HOXD8-201ENST00000313173 RCAN3Q9UKA8 241 aa35.42■■■■□ 3.26
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
HOXD8-201ENST00000313173 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.38■■■■□ 3.25
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