RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.59■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTMSP20962 102 aa28.59■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TERF1P54274 439 aa28.59■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IFT140Q96RY7 1462 aa28.59■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP1R9BQ96SB3 815 aa28.58■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SHROOM2Q13796 1616 aa28.57■■■□□ 2.16
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC173Q0VFZ6 552 aa28.57■■■□□ 2.16
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TNNQ9UQP3 1299 aa28.57■■■□□ 2.16
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMC5Q8IY18 1101 aa28.55■■■□□ 2.16
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZSCAN30Q86W11 494 aa28.53■■■□□ 2.16
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WDR63Q8IWG1 891 aa28.53■■■□□ 2.16
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STAC3Q96MF2 364 aa28.51■■■□□ 2.15
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RUNDC1Q96C34 613 aa28.49■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEP152O94986 1710 aa28.49■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRDM4Q9UKN5 801 aa28.48■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.47■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAP7D2Q96T17 732 aa28.47■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.47■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KANK1Q14678 1352 aa28.47■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC24A1O60721 1099 aa28.47■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RIPK4P57078 832 aa28.47■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.47■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.46■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SHPRHQ149N8 1683 aa28.46■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.44■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NEUROD2Q15784 382 aa28.44■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 JPH4Q96JJ6 628 aa28.44■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.44■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.43■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.43■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NASPP49321 788 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC27Q2M243 656 aa28.43■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HS1BP3Q53T59 392 aa28.39■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MSNP26038 577 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLEC17AQ6ZS10 378 aa28.38■■■□□ 2.13
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.38■■■□□ 2.13
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.37■■■□□ 2.13
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.37■■■□□ 2.13
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERVK-7P63135 1459 aa28.37■■■□□ 2.13
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA6L22H0YM25 854 aa28.33■■■□□ 2.13
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLHL40Q2TBA0 621 aa28.33■■■□□ 2.13
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.33■■■□□ 2.13
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBM10P98175 930 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRPM2O94759 1503 aa28.32■■■□□ 2.12
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.3■■■□□ 2.12
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF445P59923 1031 aa28.29■■■□□ 2.12
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MORC1Q86VD1 984 aa28.29■■■□□ 2.12
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIF2CQ99661 725 aa28.29■■■□□ 2.12
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDLIM2Q96JY6 352 aa28.26■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUCB1Q02818 461 aa28.25■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM13BQ9NYF5 915 aa28.25■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM27P14373 513 aa28.25■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.24■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.24■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SSFA2P28290 1259 aa28.23■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTPRTO14522 1441 aa28.23■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLTCL1P53675 1640 aa28.23■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BAG4O95429 457 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.22■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.22■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.21■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UQCRHLA0A096LP55 91 aa28.21■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DYNC1I1O14576 645 aa28.21■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UQCRHP07919 91 aa28.21■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CFAP53Q96M91 514 aa28.21■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.2■■■□□ 2.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.2■■■□□ 2.1
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