RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 PANK1Q8TE04 598 aa13.13□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 EFCAB5A4FU69 1503 aa13.13□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 CREBRFQ8IUR6 639 aa13.13□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 ZNF428Q96B54 188 aa13.13□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa13.12□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 CCDC34Q96HJ3 373 aa13.12□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 TRIM34Q9BYJ4 488 aa13.12□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 LNPKQ9C0E8 428 aa13.12□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 KIF3AQ9Y496 699 aa13.12□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 PLB1Q6P1J6 1458 aa13.11□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 ARHGEF11O15085 1522 aa13.11□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.11□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 WAPLQ7Z5K2 1190 aa13.11□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 ERBINQ96RT1 1412 aa13.11□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.11□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 FAM184AQ8NB25 1140 aa13.1□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 RUFY2Q8WXA3 655 aa13.1□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 H3BQV1 296 aa13.1□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 IFFO2Q5TF58 517 aa13.1□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa13.1□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 AMOTL1Q8IY63 956 aa13.1□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa13.1□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 SLC4A3P48751 1232 aa13.1□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 ANO2Q9NQ90 1003 aa13.1□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.09□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 PDE4AP27815 886 aa13.09□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 FAM161AQ3B820 660 aa13.09□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 DAPK1P53355 1430 aa13.09□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TMX3-201ENST00000299608 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.08□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 CCDC61Q9Y6R9 512 aa13.08□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 MSNP26038 577 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 CCDC30Q5VVM6 783 aa13.08□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 MCTP1Q6DN14 999 aa13.08□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa13.07□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 CABP4P57796 275 aa13.07□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 ROCK1Q13464 1354 aa13.07□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 REC8O95072 547 aa13.07□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa13.07□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa13.07□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa13.07□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 TRDNQ13061 729 aa13.06□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 FYB1O15117 783 aa13.06□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 WASHC4Q2M389 1173 aa13.06□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 BICRAQ9NZM4 1560 aa13.06□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 SURF6O75683 361 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 CCDC27Q2M243 656 aa13.06□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa13.06□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 CPLX1O14810 134 aa13.05□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 HECW1Q76N89 1606 aa13.05□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 FOXO3O43524 673 aa13.05□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 IDI1Q13907 227 aa13.05□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.04□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 SLC4A2P04920 1241 aa13.04□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 PTMSP20962 102 aa13.04□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa13.04□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 KIF6Q6ZMV9 814 aa13.03□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 GRIN2AQ12879 1464 aa13.03□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 ERC2O15083 957 aa13.03□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 IQGAP2Q13576 1575 aa13.03□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 GNAI3P08754 354 aa13.03□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13.03□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 TPM4P67936 248 aa13.02□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 SPG7Q9UQ90 795 aa13.02□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 MYL6BP14649 208 aa13.02□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 NFXL1Q6ZNB6 911 aa13.02□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 ADGRL1O94910 1474 aa13.02□□□□□ -0.32
TMX3-201ENST00000299608 PES1O00541 588 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
TMX3-201ENST00000299608 RNF20Q5VTR2 975 aa13.02□□□□□ -0.33
TMX3-201ENST00000299608 C1orf115Q9H7X2 142 aa13.02□□□□□ -0.33
TMX3-201ENST00000299608 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.02□□□□□ -0.33
TMX3-201ENST00000299608 PDE4CQ08493 712 aa13.01□□□□□ -0.33
TMX3-201ENST00000299608 TIAM1Q13009 1591 aa13.01□□□□□ -0.33
TMX3-201ENST00000299608 ADAMTS2O95450 1211 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms