RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293230.9

CYGB-201, Transcript of cytoglobin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYGB, Length 2,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYGB-201ENST00000293230 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.7■■□□□ 1.71
CYGB-201ENST00000293230 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.67■■□□□ 1.7
CYGB-201ENST00000293230 ZMYM3Q14202 1370 aa25.64■■□□□ 1.7
CYGB-201ENST00000293230 ZNF521Q96K83 1311 aa25.64■■□□□ 1.69
CYGB-201ENST00000293230 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.63■■□□□ 1.69
CYGB-201ENST00000293230 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.69
CYGB-201ENST00000293230 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.62■■□□□ 1.69
CYGB-201ENST00000293230 EVC2Q86UK5 1308 aa25.62■■□□□ 1.69
CYGB-201ENST00000293230 USP32Q8NFA0 1604 aa25.61■■□□□ 1.69
CYGB-201ENST00000293230 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.61■■□□□ 1.69
CYGB-201ENST00000293230 STK26Q9P289 416 aa25.61■■□□□ 1.69
CYGB-201ENST00000293230 PTPRMP28827 1452 aa25.58■■□□□ 1.69
CYGB-201ENST00000293230 CABP2Q9NPB3 220 aa25.58■■□□□ 1.69
CYGB-201ENST00000293230 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CYGB-201ENST00000293230 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 C3P01024 1663 aa25.57■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.57■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 PLIN1O60240 522 aa25.56■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 MORC1Q86VD1 984 aa25.56■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 SHPRHQ149N8 1683 aa25.56■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.56■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.55■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 APAF1O14727 1248 aa25.55■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 ALKQ9UM73 1620 aa25.55■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.54■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 GOLGA2Q08379 1002 aa25.54■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.52■■□□□ 1.68
CYGB-201ENST00000293230 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.51■■□□□ 1.67
CYGB-201ENST00000293230 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.5■■□□□ 1.67
CYGB-201ENST00000293230 PRAM1Q96QH2 718 aa25.5■■□□□ 1.67
CYGB-201ENST00000293230 SLFN5Q08AF3 891 aa25.49■■□□□ 1.67
CYGB-201ENST00000293230 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CYGB-201ENST00000293230 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CYGB-201ENST00000293230 A0A1W2PP64 1363 aa25.47■■□□□ 1.67
CYGB-201ENST00000293230 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CYGB-201ENST00000293230 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CYGB-201ENST00000293230 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.45■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.45■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 TNRQ92752 1358 aa25.44■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 MTHFSP49914 203 aa25.44■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.44■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 CRBNQ96SW2 442 aa25.44■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 POGKQ9P215 609 aa25.44■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 NSD2O96028 1365 aa25.44■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.43■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.43■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 ABCC11Q96J66 1382 aa25.42■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.42■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.41■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 MSH5O43196 834 aa25.4■■□□□ 1.66
CYGB-201ENST00000293230 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.39■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.37■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 NGEFQ8N5V2 710 aa25.37■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 E9PSI1 815 aa25.36■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 WWC1Q8IX03 1113 aa25.36■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 CDK19Q9BWU1 502 aa25.35■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 DLC1Q96QB1 1528 aa25.35■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 RUNDC1Q96C34 613 aa25.35■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.35■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 NLRP1Q9C000 1473 aa25.35■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 CFAP53Q96M91 514 aa25.34■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.33■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.33■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.33■■□□□ 1.65
CYGB-201ENST00000293230 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.32■■□□□ 1.64
CYGB-201ENST00000293230 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.32■■□□□ 1.64
CYGB-201ENST00000293230 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.32■■□□□ 1.64
CYGB-201ENST00000293230 NEUROD2Q15784 382 aa25.31■■□□□ 1.64
CYGB-201ENST00000293230 FYB1O15117 783 aa25.31■■□□□ 1.64
CYGB-201ENST00000293230 CABP1Q9NZU7 370 aa25.29■■□□□ 1.64
CYGB-201ENST00000293230 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CYGB-201ENST00000293230 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CYGB-201ENST00000293230 MED14O60244 1454 aa25.28■■□□□ 1.64
CYGB-201ENST00000293230 BCAR3O75815 825 aa25.28■■□□□ 1.64
CYGB-201ENST00000293230 METP08581 1390 aa25.28■■□□□ 1.64
CYGB-201ENST00000293230 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.27■■□□□ 1.64
CYGB-201ENST00000293230 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CYGB-201ENST00000293230 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CYGB-201ENST00000293230 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.26■■□□□ 1.63
CYGB-201ENST00000293230 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CYGB-201ENST00000293230 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
CYGB-201ENST00000293230 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CYGB-201ENST00000293230 ADGRB2O60241 1585 aa25.24■■□□□ 1.63
CYGB-201ENST00000293230 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CYGB-201ENST00000293230 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
CYGB-201ENST00000293230 SKAP1Q86WV1 359 aa25.22■■□□□ 1.63
CYGB-201ENST00000293230 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.2■■□□□ 1.63
CYGB-201ENST00000293230 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CYGB-201ENST00000293230 ATP7BP35670 1465 aa25.2■■□□□ 1.62
CYGB-201ENST00000293230 CCDC27Q2M243 656 aa25.2■■□□□ 1.62
CYGB-201ENST00000293230 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.18■■□□□ 1.62
CYGB-201ENST00000293230 WDR63Q8IWG1 891 aa25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms