RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 CPLX1O14810 134 aa24.74■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 ERC2O15083 957 aa24.74■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.74■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.74■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 HMGXB3Q12766 1538 aa24.73■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 TRIM29Q14134 588 aa24.73■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.72■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.71■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 PRKAR2BP31323 418 aa24.71■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.71■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 AAMPQ13685 434 aa24.71■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 PRXQ9BXM0 1461 aa24.7■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 PPP2R1AP30153 589 aa24.7■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 CDK19Q9BWU1 502 aa24.69■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 LNPKQ9C0E8 428 aa24.69■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.69■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.69■■□□□ 1.54
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USP25-202ENST00000285681 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.68■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 PANK1Q8TE04 598 aa24.67■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 CABP1Q9NZU7 370 aa24.67■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 SLC4A3P48751 1232 aa24.67■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 STRN4Q9NRL3 753 aa24.67■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 TPM3P06753 285 aa24.66■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 KLHL34Q8N239 644 aa24.66■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 ERICH2A1L162 156 aa24.65■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 CEP89Q96ST8 783 aa24.65■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.65■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 TOP2BQ02880 1626 aa24.65■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 GNAI3P08754 354 aa24.65■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.65■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.65■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.64■■□□□ 1.54
USP25-202ENST00000285681 BECN2A8MW95 431 aa24.64■■□□□ 1.53
USP25-202ENST00000285681 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.63■■□□□ 1.53
USP25-202ENST00000285681 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
USP25-202ENST00000285681 HECW1Q76N89 1606 aa24.63■■□□□ 1.53
USP25-202ENST00000285681 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.63■■□□□ 1.53
USP25-202ENST00000285681 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
USP25-202ENST00000285681 WASHC4Q2M389 1173 aa24.62■■□□□ 1.53
USP25-202ENST00000285681 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.6■■□□□ 1.53
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USP25-202ENST00000285681 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.6■■□□□ 1.53
USP25-202ENST00000285681 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.6■■□□□ 1.53
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USP25-202ENST00000285681 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
USP25-202ENST00000285681 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.58■■□□□ 1.53
USP25-202ENST00000285681 PDE4CQ08493 712 aa24.58■■□□□ 1.53
USP25-202ENST00000285681 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.58■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 TPM2P07951 284 aa24.58■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.58■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 ERBINQ96RT1 1412 aa24.57■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 CCDC27Q2M243 656 aa24.57■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.57■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 FAM177BA6PVY3 158 aa24.57■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 DAPK1P53355 1430 aa24.57■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.56■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 TPM1P09493 284 aa24.54■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.54■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 CDC45O75419 566 aa24.54■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.53■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 FSD1Q9BTV5 496 aa24.52■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.52■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 FYB1O15117 783 aa24.52■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 CABP4P57796 275 aa24.52■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 BICD2Q8TD16 824 aa24.52■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 CNTROBQ8N137 903 aa24.52■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.52■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.52■■□□□ 1.52
USP25-202ENST00000285681 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.51■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 SPG7Q9UQ90 795 aa24.51■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.51■■□□□ 1.51
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