RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 MYOM2P54296 1465 aa23.52■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 INSRP06213 1382 aa23.52■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 IL27Q8NEV9 243 aa23.52■■□□□ 1.35
PANX1-201ENST00000227638 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PANX1-201ENST00000227638 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.51■■□□□ 1.35
PANX1-201ENST00000227638 FAM161AQ3B820 660 aa23.51■■□□□ 1.35
PANX1-201ENST00000227638 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.5■■□□□ 1.35
PANX1-201ENST00000227638 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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PANX1-201ENST00000227638 IFT172Q9UG01 1749 aa23.48■■□□□ 1.35
PANX1-201ENST00000227638 ADGRB3O60242 1522 aa23.47■■□□□ 1.35
PANX1-201ENST00000227638 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.47■■□□□ 1.35
PANX1-201ENST00000227638 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PANX1-201ENST00000227638 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
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PANX1-201ENST00000227638 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PANX1-201ENST00000227638 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.47■■□□□ 1.35
PANX1-201ENST00000227638 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.47■■□□□ 1.35
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PANX1-201ENST00000227638 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.44■■□□□ 1.34
PANX1-201ENST00000227638 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.44■■□□□ 1.34
PANX1-201ENST00000227638 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.44■■□□□ 1.34
PANX1-201ENST00000227638 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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PANX1-201ENST00000227638 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.41■■□□□ 1.34
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PANX1-201ENST00000227638 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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PANX1-201ENST00000227638 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.4■■□□□ 1.34
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PANX1-201ENST00000227638 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.37■■□□□ 1.33
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PANX1-201ENST00000227638 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PANX1-201ENST00000227638 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.37■■□□□ 1.33
PANX1-201ENST00000227638 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.37■■□□□ 1.33
PANX1-201ENST00000227638 ADGRB1O14514 1584 aa23.36■■□□□ 1.33
PANX1-201ENST00000227638 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.35■■□□□ 1.33
PANX1-201ENST00000227638 NEO1Q92859 1461 aa23.35■■□□□ 1.33
PANX1-201ENST00000227638 USP19O94966 1318 aa23.34■■□□□ 1.33
PANX1-201ENST00000227638 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PANX1-201ENST00000227638 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.34■■□□□ 1.33
PANX1-201ENST00000227638 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.33■■□□□ 1.33
PANX1-201ENST00000227638 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PANX1-201ENST00000227638 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 MLECQ14165 292 aa23.32■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.31■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 PDE3AQ14432 1141 aa23.31■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 SLC24A1O60721 1099 aa23.3■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.3■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.3■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.29■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.29■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.29■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 EVC2Q86UK5 1308 aa23.29■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 RICTORQ6R327 1708 aa23.29■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 CFAP53Q96M91 514 aa23.29■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 PRAM1Q96QH2 718 aa23.29■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 GLI2P10070 1586 aa23.28■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.27■■□□□ 1.32
PANX1-201ENST00000227638 TSPOAP1O95153 1857 aa23.26■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.26■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 A0A1W2PP64 1363 aa23.25■■□□□ 1.31
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PANX1-201ENST00000227638 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.25■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
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PANX1-201ENST00000227638 POGKQ9P215 609 aa23.24■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.23■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 PIK3C2BO00750 1634 aa23.22■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 FYB1O15117 783 aa23.22■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.22■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.22■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 ARXQ96QS3 562 aa23.21■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.21■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 GSE1Q14687 1217 aa23.21■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.21■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 CABP1Q9NZU7 370 aa23.21■■□□□ 1.31
PANX1-201ENST00000227638 WDR63Q8IWG1 891 aa23.2■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 USP35Q9P2H5 1018 aa23.2■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.2■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.19■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 TRIM27P14373 513 aa23.18■■□□□ 1.3
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