RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NpatQ8BMA5 1420 aa19.93■□□□□ 0.78
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Naip7Q9JIB3 1402 aa19.92■□□□□ 0.78
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp19Q3UJD6 1360 aa19.92■□□□□ 0.78
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cep170bQ80U49 1574 aa19.9■□□□□ 0.78
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Esx1O88933 382 aa19.89■□□□□ 0.78
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abca14E9Q8F8 1683 aa19.89■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa19.89■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa19.89■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif16bB1AVY7 1312 aa19.88■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NktrP30415 1453 aa19.88■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TnikP83510 1323 aa19.87■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plekhg1F6S200 1446 aa19.87■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dcaf11Q91VU6 549 aa19.87■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CenpjQ569L8 1344 aa19.87■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stag3O70576 1240 aa19.86■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 IqubQ8CDK3 788 aa19.85■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa19.85■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nwd1A6H603 1563 aa19.85■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Iqsec2Q5DU25 1478 aa19.83■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dip2aQ8BWT5 1523 aa19.83■□□□□ 0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam71e1A1L3C1 212 aa19.82■□□□□ 0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa19.82■□□□□ 0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Afap1Q80YS6 731 aa19.81■□□□□ 0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa19.79■□□□□ 0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P2rx7Q9Z1M0 595 aa19.77■□□□□ 0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plekhh1Q80TI1 1356 aa19.76■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Uspl1Q3ULM6 1089 aa19.76■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CrbnQ8C7D2 445 aa19.76■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Shq1Q7TMX5 569 aa19.75■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cnga1P29974 684 aa19.73■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Liat1Q810M6 228 aa19.73■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcnh8P59111 1102 aa19.73■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Supt16hQ920B9 1047 aa19.73■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp32F8VPZ3 1604 aa19.71■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nlrp6Q91WS2 869 aa19.71■□□□□ 0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cps1Q8C196 1500 aa19.69■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf541Q0GGX2 1363 aa19.69■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slit3Q9WVB4 1523 aa19.68■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Golga2Q921M4 999 aa19.68■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ralbp1Q62172 648 aa19.67■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc30Q8BVF4 654 aa19.67■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stk26Q99JT2 416 aa19.67■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q9D9H8 365 aa19.66■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zmym3Q9JLM4 1370 aa19.66■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa19.65■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arap3Q8R5G7 1538 aa19.65■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gsto1O09131 240 aa19.64■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 GsdmaQ9EST1 446 aa19.64■□□□□ 0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif1aP33173 1695 aa19.64■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdk19Q8BWD8 501 aa19.61■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa19.61■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zranb1Q7M760 708 aa19.6■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myt1Q8CFC2 1127 aa19.6■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rwdd1Q9CQK7 243 aa19.6■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 FanciQ8K368 1330 aa19.6■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa19.6■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NinlQ6ZQ12 1394 aa19.6■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dip2bQ3UH60 1574 aa19.59■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa19.59■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp1b4Q99ME6 356 aa19.57■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnajc5gQ8C632 165 aa19.56■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PtpruB1AUH1 1446 aa19.56■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Egfem1Q8C088 590 aa19.56■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa19.56■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Map3k19E9Q3S4 1311 aa19.55■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 IghaA0A0A6YXW6 389 aa19.55■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mdc1Q5PSV9 1707 aa19.55■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NeflP08551 543 aa19.54■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc4a3P16283 1227 aa19.53■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Asxl2Q8BZ32 1370 aa19.53■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf521Q6KAS7 1311 aa19.53■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa19.52■□□□□ 0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pik3r4Q8VD65 1358 aa19.52■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gas2l2Q5SSG4 860 aa19.51■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trim28Q62318 834 aa19.51■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa19.5■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pak3Q61036 559 aa19.5■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Neurod2Q62414 383 aa19.5■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tsen2Q6P7W5 460 aa19.49■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spef2Q8C9J3 1734 aa19.49■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam135bQ9DAI6 1403 aa19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 61.1 ms