RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nutm1Q8BHP2 1126 aa20.44■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa20.44■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abcc1O35379 1528 aa20.44■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plin1Q8CGN5 517 aa20.44■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pnmal2G3X9N3 661 aa20.43■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa20.43■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim58Q5NCC9 485 aa20.43■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atf7ipQ7TT18 1306 aa20.41■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AatkQ80YE4 1365 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Setd1aE9PYH6 1716 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf316Q6PGE4 1016 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep170Q6A065 1588 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cfap74Q3UY96 1578 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nectin2P32507 530 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmco5bQ80X59 307 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stard8Q8K031 1019 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf17Q99MV7 1640 aa20.37■□□□□ 0.85
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dusp27Q148W8 1138 aa20.37■□□□□ 0.85
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Shq1Q7TMX5 569 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col17a1Q07563 1470 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myo3aQ8K3H5 1613 aa20.33■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc60Q8C4J0 545 aa20.33■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abcc3B2RX12 1523 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ShprhQ7TPQ3 1674 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AU022751B1B0V2 589 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Birc3O08863 600 aa20.31■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdcl3Q8BVF2 240 aa20.31■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rfx1P48377 963 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aplp1Q03157 653 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9D9H8 365 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SlkO54988 1233 aa20.29■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sptbn5F6UCX4 1208 aa20.28■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CenpjQ569L8 1344 aa20.28■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttc41Q692V3 1318 aa20.28■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Robo2Q7TPD3 1470 aa20.28■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa20.27■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GorabQ8BRM2 368 aa20.27■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim44Q9QXA7 346 aa20.27■□□□□ 0.84
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igf1rQ60751 1373 aa20.26■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plppr3Q7TPB0 716 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rabep1O35551 862 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NhsB1AV60 1647 aa20.23■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nphp4P59240 1425 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AU019823E9PUQ3 292 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kidins220E9Q9B7 1793 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa20.21■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa20.21■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptch1Q61115 1434 aa20.21■□□□□ 0.83
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ssh1Q76I79 1042 aa20.2■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa20.2■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pola1P33609 1465 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abca8bQ8K440 1620 aa20.17■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abca6Q8K441 1624 aa20.17■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pibf1E9Q6K3 756 aa20.17■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc12a5Q91V14 1138 aa20.17■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Catsper2A2ARP9 588 aa20.16■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cog6Q8R3I3 657 aa20.16■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdk19Q8BWD8 501 aa20.16■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnn1Q9EQR3 537 aa20.16■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PalmQ9Z0P4 383 aa20.16■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map7O88735 730 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NgefQ8CHT1 710 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gtf2a1Q99PM3 378 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nos1Q9Z0J4 1429 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gsto1O09131 240 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mcm10Q0VBD2 885 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PtprtQ99M80 1454 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chd1P40201 1711 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mcm4P49717 862 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AnkarA2RT91 1465 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CastP51125 788 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Neurl4Q5NCX5 1563 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hecw1Q8K4P8 1604 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Uggt2E9Q4X2 1504 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf521Q6KAS7 1311 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il4rP16382 810 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif18aQ91WD7 886 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cfap65Q3V0B4 1847 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.2 ms