RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W SEN15Q04675 128 aa4.77□□□□□ -1.65
YLR349WYLR349W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
YLR349WYLR349W SFT1P43682 97 aa4.76□□□□□ -1.65
YLR349WYLR349W YGL230CP53074 147 aa4.76□□□□□ -1.65
YLR349WYLR349W YIL134C-AQ45U18 67 aa4.76□□□□□ -1.65
YLR349WYLR349W FYV12Q08559 129 aa4.74□□□□□ -1.65
YLR349WYLR349W YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa4.74□□□□□ -1.65
YLR349WYLR349W OST2P46964 130 aa4.73□□□□□ -1.65
YLR349WYLR349W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
YLR349WYLR349W FYV7Q12247 151 aa4.73□□□□□ -1.65
YLR349WYLR349W DSE2P38844 325 aa4.71□□□□□ -1.66
YLR349WYLR349W TDA8Q6B2U8 126 aa4.71□□□□□ -1.66
YLR349WYLR349W UIP3P39547 235 aa4.7□□□□□ -1.66
YLR349WYLR349W FUN14P18411 198 aa4.69□□□□□ -1.66
YLR349WYLR349W SSS1P35179 80 aa4.69□□□□□ -1.66
YLR349WYLR349W Q0017Q9ZZX8 53 aa4.69□□□□□ -1.66
YLR349WYLR349W YAR1P46683 200 aa4.68□□□□□ -1.66
YLR349WYLR349W COA6Q3E846 104 aa4.67□□□□□ -1.66
YLR349WYLR349W YJR128WP47162 119 aa4.65□□□□□ -1.67
YLR349WYLR349W HUR1P45820 110 aa4.64□□□□□ -1.67
YLR349WYLR349W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
YLR349WYLR349W YDR210WQ03482 75 aa4.64□□□□□ -1.67
YLR349WYLR349W ELC1Q03071 99 aa4.62□□□□□ -1.67
YLR349WYLR349W YLR162WQ06235 118 aa4.61□□□□□ -1.67
YLR349WYLR349W YJL009WP47078 108 aa4.59□□□□□ -1.67
YLR349WYLR349W COF1Q03048 143 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
YLR349WYLR349W MIC10Q96VH5 97 aa4.59□□□□□ -1.67
YLR349WYLR349W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa4.58□□□□□ -1.68
YLR349WYLR349W YER187WP40102 141 aa4.57□□□□□ -1.68
YLR349WYLR349W ECM19Q06011 112 aa4.56□□□□□ -1.68
YLR349WYLR349W NAT5Q08689 176 aa4.56□□□□□ -1.68
YLR349WYLR349W TSC3Q3E790 80 aa4.56□□□□□ -1.68
YLR349WYLR349W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
YLR349WYLR349W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa4.55□□□□□ -1.68
YLR349WYLR349W YFR009W-AP0C5M9 85 aa4.52□□□□□ -1.69
YLR349WYLR349W SHH4Q06236 168 aa4.52□□□□□ -1.69
YLR349WYLR349W YLR361C-AQ3E795 98 aa4.51□□□□□ -1.69
YLR349WYLR349W YJR107C-AP0CT86 78 aa4.5□□□□□ -1.69
YLR349WYLR349W YER181CP40097 107 aa4.5□□□□□ -1.69
YLR349WYLR349W EDC1P53080 175 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
YLR349WYLR349W ICS3P47034 131 aa4.48□□□□□ -1.69
YLR349WYLR349W ATP18P81450 59 aa4.48□□□□□ -1.69
YLR349WYLR349W YLR296WQ05898 108 aa4.48□□□□□ -1.69
YLR349WYLR349W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
YLR349WYLR349W YHR073W-AP0C5N7 58 aa4.46□□□□□ -1.7
YLR349WYLR349W PAI3P01094 68 aa4.45□□□□□ -1.7
YLR349WYLR349W POP7P38291 140 aa4.44□□□□□ -1.7
YLR349WYLR349W RPS29AP41057 56 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
YLR349WYLR349W CGR1P53188 120 aa4.43□□□□□ -1.7
YLR349WYLR349W YER175W-AQ8TGU4 54 aa4.42□□□□□ -1.7
YLR349WYLR349W YPR153WQ06537 140 aa4.41□□□□□ -1.7
YLR349WYLR349W YDL012CQ12489 107 aa4.4□□□□□ -1.71
YLR349WYLR349W COX23P38824 151 aa4.39□□□□□ -1.71
YLR349WYLR349W RPS29BP41058 56 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
YLR349WYLR349W YJL144WP47009 104 aa4.39□□□□□ -1.71
YLR349WYLR349W YOL014WQ08110 124 aa4.39□□□□□ -1.71
YLR349WYLR349W YLR363W-AQ3E747 85 aa4.39□□□□□ -1.71
YLR349WYLR349W YOR316C-AQ3E806 69 aa4.38□□□□□ -1.71
YLR349WYLR349W YGR164WP53291 111 aa4.37□□□□□ -1.71
YLR349WYLR349W YGL034CP53186 121 aa4.36□□□□□ -1.71
YLR349WYLR349W TIM11P81449 96 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
YLR349WYLR349W YML108WQ03759 105 aa4.32□□□□□ -1.72
YLR349WYLR349W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
YLR349WYLR349W RPL38P49167 78 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
YLR349WYLR349W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa4.28□□□□□ -1.72
YLR349WYLR349W YAR064WP39563 99 aa4.27□□□□□ -1.73
YLR349WYLR349W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
YLR349WYLR349W ISD11Q6Q560 94 aa4.23□□□□□ -1.73
YLR349WYLR349W TDA2P40045 126 aa4.22□□□□□ -1.73
YLR349WYLR349W YBR016WP38216 128 aa4.2□□□□□ -1.74
YLR349WYLR349W YOR304C-AO14468 76 aa4.19□□□□□ -1.74
YLR349WYLR349W YHL042WP38729 150 aa4.18□□□□□ -1.74
YLR349WYLR349W SAE3P89114 91 aa4.18□□□□□ -1.74
YLR349WYLR349W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
YLR349WYLR349W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa4.15□□□□□ -1.75
YLR349WYLR349W YCR050CP25630 102 aa4.13□□□□□ -1.75
YLR349WYLR349W YPL080CQ02826 108 aa4.1□□□□□ -1.75
YLR349WYLR349W YNL198CP40166 100 aa4.09□□□□□ -1.75
YLR349WYLR349W ATP20Q12233 115 aa4.08□□□□□ -1.76
YLR349WYLR349W HHF1P02309 103 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
YLR349WYLR349W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
YLR349WYLR349W GLC8P41818 229 aa4.06□□□□□ -1.76
YLR349WYLR349W YML054C-AQ3E809 52 aa4.06□□□□□ -1.76
YLR349WYLR349W YLR255CO13574 117 aa4□□□□□ -1.77
YLR349WYLR349W RPA12P32529 125 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YLR349WYLR349W LIP1Q03579 150 aa4□□□□□ -1.77
YLR349WYLR349W RPL37AP49166 88 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YLR349WYLR349W YBL008W-AQ3E821 79 aa3.99□□□□□ -1.77
YLR349WYLR349W RAD6P06104 172 aa3.98□□□□□ -1.77
YLR349WYLR349W LSM8P47093 109 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YLR349WYLR349W YBL044WP38194 122 aa3.96□□□□□ -1.78
YLR349WYLR349W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YLR349WYLR349W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YLR349WYLR349W COX8P04039 78 aa3.93□□□□□ -1.78
YLR349WYLR349W YGR039WP53225 103 aa3.92□□□□□ -1.78
YLR349WYLR349W YGR146C-AQ8TGT9 53 aa3.92□□□□□ -1.78
YLR349WYLR349W YPR170W-BP0C5R9 85 aa3.91□□□□□ -1.78
YLR349WYLR349W YIL156W-BQ2V2P4 73 aa3.88□□□□□ -1.79
YLR349WYLR349W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa3.86□□□□□ -1.79
YLR349WYLR349W YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.5 ms