RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		2.96	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		2.96	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	VPS55	P47111	140 aa		2.95	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	SNA2	P56508	79 aa		2.95	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		2.95	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		2.95	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		2.95	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	LST8	P41318	303 aa		2.94	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	YOR314W	Q12506	109 aa		2.94	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		2.94	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	HOR7	Q05827	59 aa		2.93	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	COA2	Q3E823	68 aa		2.93	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		2.92	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		2.92	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	IRC21	Q04772	201 aa		2.91	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		2.91	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	YAL065C	O13511	128 aa		2.9	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		2.9	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	SPC1	P46965	94 aa		2.9	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	VAM10	Q08474	114 aa		2.9	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		2.9	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	YJR146W	P47174	117 aa		2.89	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	MRX7	P53869	86 aa		2.89	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		2.88	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	YBL071C	P38185	102 aa		2.88	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	DSE2	P38844	325 aa		2.88	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	MPC2	P38857	129 aa		2.88	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	FPR2	P32472	135 aa		2.87	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	YIL163C	P40448	117 aa		2.87	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	PRM7	Q12459	698 aa		2.87	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	QCR9	P22289	66 aa		2.86	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	YMR122C	Q03879	124 aa		2.86	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		2.86	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	BSC4	P53841	131 aa		2.85	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	COX19	Q3E731	98 aa		2.85	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		2.85	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		2.85	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	YHR173C	P38864	112 aa		2.84	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	SPI1	P40092	148 aa		2.84	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	AIM19	P40502	157 aa		2.84	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	YMR007W	Q03675	126 aa		2.84	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	YLR162W	Q06235	118 aa		2.84	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		2.84	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	COA3	Q3E7B2	85 aa		2.84	□□□□□ -1.95
KTR2	YKR061W	PAU6	P0CE90	120 aa		2.83	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	PAU18	P0CE91	120 aa		2.83	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	PAU8	P0CE92	120 aa		2.83	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	PAU11	P0CE93	120 aa		2.83	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	AUA1	P32450	94 aa		2.83	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	YSY6	P38374	65 aa		2.83	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	PAU13	P38725	120 aa		2.83	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	YGR025W	P53216	100 aa		2.83	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	PAU4	P53427	120 aa		2.83	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	PAU10	Q03050	120 aa		2.83	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	PAU9	Q3E770	120 aa		2.83	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	PAU1	P0CE88	120 aa		2.81	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	PAU14	P0CE89	120 aa		2.81	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		2.81	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		2.8	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	YDR010C	Q12426	110 aa		2.79	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	YBR219C	P38317	127 aa		2.78	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	HUA1	P40325	198 aa		2.78	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	LCL2	Q08045	131 aa		2.78	□□□□□ -1.96
KTR2	YKR061W	PAU7	P39545	55 aa		2.77	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	TOM7	P53507	60 aa		2.77	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	CCW12	Q12127	133 aa		2.77	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	YDR210W	Q03482	75 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	PAU20	Q08322	120 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	YMR141C	P40211	102 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	YEL008W	P40001	126 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	YJL009W	P47078	108 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	YCR001W	P25347	104 aa		2.72	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	MRPS12	P53732	153 aa		2.72	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		2.72	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		2.72	□□□□□ -1.97
KTR2	YKR061W	SGF11	Q03067	99 aa		2.7	□□□□□ -1.98
KTR2	YKR061W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		2.69	□□□□□ -1.98
KTR2	YKR061W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		2.66	□□□□□ -1.98
KTR2	YKR061W	HUB1	Q6Q546	73 aa		2.66	□□□□□ -1.98
KTR2	YKR061W	YLR255C	O13574	117 aa		2.65	□□□□□ -1.99
KTR2	YKR061W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		2.65	□□□□□ -1.99
KTR2	YKR061W	ATP17	Q06405	101 aa		2.65	□□□□□ -1.99
KTR2	YKR061W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
KTR2	YKR061W	AQY2	P0CD90	149 aa		2.63	□□□□□ -1.99
KTR2	YKR061W	YOR072W	Q08486	104 aa		2.63	□□□□□ -1.99
KTR2	YKR061W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		2.63	□□□□□ -1.99

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 71.3 ms