RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YPL278CQ08990 100 aa2.26□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YPR013CQ12145 317 aa2.26□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C COX23P38824 151 aa2.25□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C SNA2P56508 79 aa2.25□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa2.25□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C RTC6O14464 93 aa2.24□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YBR219CP38317 127 aa2.24□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C RPL29P05747 59 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YCR041WP37265 110 aa2.24□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C COX14P39103 70 aa2.24□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C POR2P40478 281 aa2.24□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YIL156W-BQ2V2P4 73 aa2.24□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C SDH6Q3E785 79 aa2.24□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YPR010C-AA5Z2X5 72 aa2.23□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YDR010CQ12426 110 aa2.23□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C RPL38P49167 78 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YGL260WP53056 76 aa2.23□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YBR200W-AQ3E755 54 aa2.23□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YEL008WP40001 126 aa2.22□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YOR032W-AQ8TGS1 66 aa2.22□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YMR001C-AQ8TGS9 76 aa2.22□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C SPC1P46965 94 aa2.22□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YDR114CQ04597 100 aa2.22□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C CCW12Q12127 133 aa2.22□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YOR034C-AQ3E735 80 aa2.22□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YLL006W-AQ3E814 58 aa2.22□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YLR307C-AQ3E825 87 aa2.21□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C YBR027CP38220 110 aa2.21□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C AQY2P0CD90 149 aa2.2□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C YLR157W-DP0CE99 70 aa2.2□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C YMR122W-AQ3E842 84 aa2.2□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C YHR125WP38831 101 aa2.19□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C SIP18P50263 79 aa2.19□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C YDL241WQ07738 123 aa2.19□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C YIL102CP40488 101 aa2.18□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C VAM10Q08474 114 aa2.18□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa2.17□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C YGL014C-AP0C5N1 53 aa2.16□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C RPS27AP35997 82 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C RPS27BP38711 82 aa2.16□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C IGD1P43598 195 aa2.16□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C ECM19Q06011 112 aa2.15□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C YHR213W-BQ8TGK1 99 aa2.15□□□□□ -2.06
DOA4YDR069C FPR1P20081 114 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YGR025WP53216 100 aa2.15□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa2.15□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C PMP3P87284 55 aa2.14□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YJL133C-AQ3E7A3 74 aa2.14□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YMR230W-AQ3E7B5 62 aa2.14□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C LCL2Q08045 131 aa2.13□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C FAS1P07149 2051 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C DDR2P89113 61 aa2.13□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YDR210WQ03482 75 aa2.13□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C HOR7Q05827 59 aa2.13□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C BEM2P39960 2167 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C AUA1P32450 94 aa2.12□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YER084WP40057 128 aa2.12□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YIL086CP40503 102 aa2.12□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YFL067WP43537 175 aa2.12□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YDL012CQ12489 107 aa2.12□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YOR011W-AQ3E807 68 aa2.12□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YMR105W-AQ8TGS8 64 aa2.12□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C COX8P04039 78 aa2.11□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YEL014CP39999 101 aa2.11□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C SGF11Q03067 99 aa2.11□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YBR230W-AQ3E762 66 aa2.11□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C MVB12P42939 101 aa2.11□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YOL085CQ99345 113 aa2.1□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YBL039W-BP0C268 59 aa2.1□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YAR064WP39563 99 aa2.1□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YJL127C-BQ3E828 52 aa2.1□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C YER078W-AQ3E7A2 54 aa2.09□□□□□ -2.07
DOA4YDR069C RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa2.08□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C YGL041C-BQ3E750 60 aa2.07□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C Q0032Q9ZZX7 96 aa2.07□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C SEC16P48415 2195 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C RPC10P40422 70 aa2.07□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C YPR195CQ06594 109 aa2.06□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C BLM10P43583 2143 aa2.06□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C YHR032W-AP0C5N6 59 aa2.05□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C YDR115WQ04598 105 aa2.05□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C RPL39P04650 51 aa2.04□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C YGR240C-AQ3E786 66 aa2.04□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C CMC4Q3E7A9 73 aa2.04□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C RPL33BP41056 107 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
DOA4YDR069C YLR255CO13574 117 aa2.03□□□□□ -2.09
DOA4YDR069C YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa2.03□□□□□ -2.09
DOA4YDR069C GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data2.02□□□□□ -2.09not detected
DOA4YDR069C YDR524C-BQ3E6R4 66 aa2.02□□□□□ -2.09
DOA4YDR069C YOR072WQ08486 104 aa2.01□□□□□ -2.09
DOA4YDR069C YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa2.01□□□□□ -2.09
DOA4YDR069C YGR146C-AQ8TGT9 53 aa2.01□□□□□ -2.09
DOA4YDR069C COX7P10174 60 aa2□□□□□ -2.09
DOA4YDR069C RPL33AP05744 107 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
DOA4YDR069C YCL042WP25572 119 aa1.99□□□□□ -2.09
DOA4YDR069C BRR2P32639 2163 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
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