RNA–Protein interactions for RNA: YHR181W

SVP26, Transcript of Integral membrane protein of the early Golgi apparatus and ER, yeast

Gene SVP26, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SVP26	YHR181W	YCR099C	P25657	155 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SVP26	YHR181W	YEA6	P39953	335 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SVP26	YHR181W	SNN1	P48232	102 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SVP26	YHR181W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
SVP26	YHR181W	RTR2	Q12378	196 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SVP26	YHR181W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SVP26	YHR181W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SVP26	YHR181W	BLM10	P43583	2143 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SVP26	YHR181W	ECM29	P38737	1868 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YHR130C	P38834	111 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	GTT1	P40582	234 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	VPS55	P47111	140 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	FKS3	Q04952	1785 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	COX23	P38824	151 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YER187W	P40102	141 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	VMA21	P41806	77 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	PAM16	P42949	149 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YFR035C	P43608	114 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YGR164W	P53291	111 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	PAU12	P53343	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	LCL1	Q02786	101 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YDR010C	Q12426	110 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	LYS2	P07702	1392 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	SRB6	P32570	121 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YHR173C	P38864	112 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YAR029W	P39549	74 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	SWC7	Q06707	132 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YLR042C	Q07990	161 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YOR304C-A	O14468	76 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	PAU19	P0CE85	124 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	PAU3	P25610	124 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	AUA1	P32450	94 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	PAU2	P32612	120 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	PAU24	P38155	120 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	HUR1	P45820	110 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YOL118C	Q08259	102 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	SHU1	P38751	150 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YIL086C	P40503	102 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YIR020C	P40575	100 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	IMP2	P46972	177 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	RUB1	Q03919	77 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	BPH1	P25356	2167 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	ATX1	P38636	73 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	PAU15	P40585	124 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	MRPS12	P53732	153 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	COX12	Q01519	83 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	COX19	Q3E731	98 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		0.28	□□□□□ -2.36
SVP26	YHR181W	PAU16	P35994	123 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	MPC2	P38857	129 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	YOS1	Q3E834	85 aa		0.27	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	CCW14	O13547	238 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	YCR101C	P25607	182 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	MRP17	P28778	131 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	SNA2	P56508	79 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	KRE5	P22023	1365 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	PMD1	P32634	1753 aa		0.26	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	YLR255C	O13574	117 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		0.25	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	YBR292C	P38357	123 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	MRX7	P53869	86 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	PAU20	Q08322	120 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	MIC10	Q96VH5	97 aa		0.24	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	YNL190W	P53872	204 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	ICY1	Q04329	127 aa		0.23	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	PAU1	P0CE88	120 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	PAU14	P0CE89	120 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	PAU6	P0CE90	120 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	PAU18	P0CE91	120 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	PAU8	P0CE92	120 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	PAU11	P0CE93	120 aa		0.22	□□□□□ -2.37
SVP26	YHR181W	UBC4	P15731	148 aa		0.22	□□□□□ -2.37

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