RNA–Protein interactions for RNA: YGR219W

YGR219W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGR219W, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR219W	YGR219W	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	YOS1	Q3E834	85 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	COX19	Q3E731	98 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	MIC10	Q96VH5	97 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	LYS2	P07702	1392 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	YCR101C	P25607	182 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	YDR210W	Q03482	75 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	SNF2	P22082	1703 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	MPC2	P38857	129 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	COX12	Q01519	83 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YGR219W	YGR219W	BNI1	P41832	1953 aa		0.84	□□□□□ -2.28
YGR219W	YGR219W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YGR219W	YGR219W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YGR219W	YGR219W	BLM10	P43583	2143 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YGR219W	YGR219W	UBC4	P15731	148 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YGR219W	YGR219W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YGR219W	YGR219W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YGR219W	YGR219W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YGR219W	YGR219W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
YGR219W	YGR219W	TSC11	P40061	1430 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YGR219W	YGR219W	YRF1-6	P53819	1859 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YGR219W	YGR219W	YBR090C	P38253	122 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YGR219W	YGR219W	KRE5	P22023	1365 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YGR219W	YGR219W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		0.78	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	UBC5	P15732	148 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	SNA2	P56508	79 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	MRX7	P53869	86 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	SRB8	P25648	1427 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	PAU5	P43575	122 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	MIX14	Q04341	121 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	MRP17	P28778	131 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	ICY1	Q04329	127 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
YGR219W	YGR219W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	PAU6	P0CE90	120 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	PAU18	P0CE91	120 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	ROX3	P25046	220 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	0.7	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	MDS3	P53094	1487 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	YBR292C	P38357	123 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	YNL190W	P53872	204 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	PAU20	Q08322	120 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	SSN2	P38931	1420 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YGR219W	YGR219W	YBL071C	P38185	102 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	YHL005C	P38752	130 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	RSM18	P40033	138 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	AIM19	P40502	157 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	PDR11	P40550	1411 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	PAU1	P0CE88	120 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	PAU14	P0CE89	120 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	PAU8	P0CE92	120 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	PAU11	P0CE93	120 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	PAU13	P38725	120 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	EMC5	P40540	141 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	PAU10	Q03050	120 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	FYV7	Q12247	151 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	PAU9	Q3E770	120 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	BPT1	P14772	1559 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	HMRA1	P0CY11	126 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	YNL198C	P40166	100 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	RPC10	P40422	70 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YGR219W	YGR219W	SPC1	P46965	94 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YGR219W	YGR219W	PAU4	P53427	120 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGR219W	YGR219W	NHP10	Q03435	203 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGR219W	YGR219W	MYO1	P08964	1928 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YGR219W	YGR219W	REV3	P14284	1504 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGR219W	YGR219W	ATX1	P38636	73 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YGR219W	YGR219W	RRT15	Q3E811	62 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGR219W	YGR219W	CAT8	P39113	1433 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YGR219W	YGR219W	RSF2	P46974	1380 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YGR219W	YGR219W	NTE1	Q04958	1679 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YGR219W	YGR219W	TAO3	P40468	2376 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YGR219W	YGR219W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YGR219W	YGR219W	RIM15	P43565	1770 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YGR219W	YGR219W	BUD4	P47136	1447 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YGR219W	YGR219W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YGR219W	YGR219W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YGR219W	YGR219W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YGR219W	YGR219W	ZEO1	Q08245	113 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YGR219W	YGR219W	YBR016W	P38216	128 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YGR219W	YGR219W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YGR219W	YGR219W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YGR219W	YGR219W	COX7	P10174	60 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YGR219W	YGR219W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YGR219W	YGR219W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.44	□□□□□ -2.34

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