RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W LDB16P25587 256 aa4.17□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W YEL067CP39978 195 aa4.17□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W UBC7Q02159 165 aa4.17□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W VAR1P02381 398 aa4.16□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W YDL022C-AP0C5L6 82 aa4.16□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W INO4P13902 151 aa4.16□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W ATX1P38636 73 aa4.16□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W YHL037CP38733 133 aa4.16□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W OST2P46964 130 aa4.16□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W YNL046WP53956 172 aa4.16□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W COA3Q3E7B2 85 aa4.16□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W YER121WP40076 114 aa4.15□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W TOS6P48560 102 aa4.15□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W YNR077CP53758 84 aa4.15□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W YOL160WQ08321 113 aa4.15□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W FCY1Q12178 158 aa4.15□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.74
VHS1YDR247W FMP27Q06179 2628 aa4.15□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YIA6P40556 373 aa4.14□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W IGD1P43598 195 aa4.14□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YNL184CP53876 108 aa4.14□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa4.14□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W ISD11Q6Q560 94 aa4.14□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W INO2P26798 304 aa4.14□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W IES6P32617 166 aa4.14□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W SPI1P40092 148 aa4.14□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YDR115WQ04598 105 aa4.14□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W HPA2Q06592 156 aa4.14□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YEL045CP32616 141 aa4.13□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data4.13□□□□□ -1.75not detected
VHS1YDR247W YNL217WP40152 326 aa4.13□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YFL065CP43539 102 aa4.13□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W AIM11P87275 137 aa4.13□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YPR203WQ08994 102 aa4.13□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YCR075W-AQ3E830 75 aa4.13□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W IGO2Q9P305 131 aa4.13□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YAR1P46683 200 aa4.12□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YGR025WP53216 100 aa4.12□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W AIM34Q03673 198 aa4.12□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W COX10P21592 462 aa4.11□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YER085CP40058 173 aa4.11□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W POR2P40478 281 aa4.11□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YGR219WP53307 113 aa4.11□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YLR194CQ05777 254 aa4.11□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa4.11□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W IRA1P18963 3092 aa4.1□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W PHO85P17157 305 aa4.1□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W RPA12P32529 125 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W PRM7Q12459 698 aa4.1□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W ATP15P21306 62 aa4.09□□□□□ -1.75
VHS1YDR247W YOR304C-AO14468 76 aa4.08□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W MID2P36027 376 aa4.08□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W DCV1P43595 202 aa4.08□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YIP3P53633 176 aa4.08□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YOL085CQ99345 113 aa4.08□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YPR117WQ06116 2489 aa4.08□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YHR130CP38834 111 aa4.07□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YBR200W-AQ3E755 54 aa4.07□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W RPL28P02406 149 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W MIC12P38341 106 aa4.06□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YHR022CP38763 256 aa4.06□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W DSE2P38844 325 aa4.06□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W FIP1P45976 327 aa4.06□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YJR146WP47174 117 aa4.06□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YPL229WQ99395 206 aa4.06□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W CCW14O13547 238 aa4.05□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W KRE1P17260 313 aa4.05□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W UGX2P32772 223 aa4.05□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W MRPS12P53732 153 aa4.05□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YNL190WP53872 204 aa4.05□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W SBH2P52871 88 aa4.04□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YPS5P53057 165 aa4.04□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W ABF2Q02486 183 aa4.04□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W CCW12Q12127 133 aa4.04□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YAL063C-AQ3E791 96 aa4.04□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W BPH1P25356 2167 aa4.04□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W PEX17P40155 199 aa4.03□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YPR013CQ12145 317 aa4.03□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YOR011W-AQ3E807 68 aa4.03□□□□□ -1.76
VHS1YDR247W YCR085WP25650 117 aa4.02□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W NRG2P38082 220 aa4.02□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W HAL1Q01766 294 aa4.02□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YFL041W-AQ3E817 63 aa4.02□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W Q0255P03881 472 aa4.02□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W SMP1P38128 452 aa4.02□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YLR042CQ07990 161 aa4.02□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa4.02□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YBR209WP38311 105 aa4.01□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W SHU1P38751 150 aa4.01□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YER135CP40082 130 aa4.01□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YBL112CQ3E7Y4 105 aa4.01□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W TRA1P38811 3744 aa4□□□□□ -1.77
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