RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL171C	YNL171C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YNL171C	YNL171C	SNF2	P22082	1703 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YNL171C	YNL171C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YNL171C	YNL171C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YNL171C	YNL171C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YNL171C	YNL171C	YGR042W	P53227	271 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YNL171C	YNL171C	TIM8	P57744	87 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YNL171C	YNL171C	YKL044W	P36092	106 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL171C	YNL171C	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YNL171C	YNL171C	YFR035C	P43608	114 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YNL171C	YNL171C	LCL1	Q02786	101 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YNL171C	YNL171C	ARL3	Q02804	198 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YNL171C	YNL171C	AUA1	P32450	94 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YNL171C	YNL171C	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YNL171C	YNL171C	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YNL171C	YNL171C	SAE3	P89114	91 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YNL171C	YNL171C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YNL171C	YNL171C	GPI19	Q04082	140 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YNL171C	YNL171C	SLO1	Q3E784	85 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL171C	YNL171C	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL171C	YNL171C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YNL171C	YNL171C	NKP2	Q06162	153 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL171C	YNL171C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YNL171C	YNL171C	SNF11	P38956	169 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL171C	YNL171C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	YEA6	P39953	335 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	MYO1	P08964	1928 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	DYN2	Q02647	92 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	YDR010C	Q12426	110 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	YPK9	Q12697	1472 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	CYB5	P40312	120 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	SPC2	Q04969	178 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	OST5	Q92316	86 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	POP7	P38291	140 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	PAU12	P53343	120 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	YRF1-6	P53819	1859 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	MRP49	P32388	137 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	YPL261C	Q08976	102 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	COX23	P38824	151 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL171C	YNL171C	SPC24	Q04477	213 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	FRQ1	Q06389	190 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	RAD50	P12753	1312 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	YHR130C	P38834	111 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	MRPS12	P53732	153 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	PCC1	Q3E833	88 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	VPS55	P47111	140 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	AIM11	P87275	137 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	ECM5	Q03214	1411 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	ACP1	P32463	125 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	TDA2	P40045	126 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	YLR118C	Q12354	227 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	DNA2	P38859	1522 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	YIR020C	P40575	100 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YNL171C	YNL171C	YHR173C	P38864	112 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YNL171C	YNL171C	RPB11	P38902	120 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YNL171C	YNL171C	VMA7	P39111	118 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YNL171C	YNL171C	YER187W	P40102	141 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YNL171C	YNL171C	YCR099C	P25657	155 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YNL171C	YNL171C	SNN1	P48232	102 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YNL171C	YNL171C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YNL171C	YNL171C	TAO3	P40468	2376 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YNL171C	YNL171C	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YNL171C	YNL171C	DAD1	Q12248	94 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YNL171C	YNL171C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
YNL171C	YNL171C	PAU24	P38155	120 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YNL171C	YNL171C	PAU2	P32612	120 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL171C	YNL171C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YNL171C	YNL171C	GTT1	P40582	234 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL171C	YNL171C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL171C	YNL171C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YNL171C	YNL171C	YLR255C	O13574	117 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL171C	YNL171C	YAR029W	P39549	74 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL171C	YNL171C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL171C	YNL171C	PAM16	P42949	149 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL171C	YNL171C	PAU19	P0CE85	124 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL171C	YNL171C	PAU3	P25610	124 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL171C	YNL171C	YIL086C	P40503	102 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL171C	YNL171C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YNL171C	YNL171C	SHU1	P38751	150 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL171C	YNL171C	APS2	Q00381	147 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL171C	YNL171C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YNL171C	YNL171C	YLR042C	Q07990	161 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL171C	YNL171C	IMP2	P46972	177 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL171C	YNL171C	RTR2	Q12378	196 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL171C	YNL171C	YOL118C	Q08259	102 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YNL171C	YNL171C	COX19	Q3E731	98 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YNL171C	YNL171C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YNL171C	YNL171C	CCW14	O13547	238 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL171C	YNL171C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YNL171C	YNL171C	YNL190W	P53872	204 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YNL171C	YNL171C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YNL171C	YNL171C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.2 ms