RNA–Protein interactions for RNA: YMR019W

STB4, Transcript of Putative transcription factor, yeast

Gene STB4, Length 2,850 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB4	YMR019W	HAP2	P06774	265 aa		0.98	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	FIT1	Q04433	528 aa		0.98	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	OCA6	Q12454	224 aa		0.98	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	TY1B-H	O13535	1793 aa		0.98	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	HAP3	P13434	144 aa		0.98	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	MRPL44	P19956	98 aa		0.98	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	HIR3	P47171	1648 aa		0.97	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	ESP1	Q03018	1630 aa		0.97	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	ATG2	P53855	1592 aa		0.97	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	CDC25	P04821	1589 aa		0.97	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	RKR1	Q04781	1562 aa		0.97	□□□□□ -2.25
STB4	YMR019W	SNT2	P53127	1403 aa		0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YOR093C	Q12275	1648 aa		0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YCR101C	P25607	182 aa		0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	LST8	P41318	303 aa		0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	SED1	Q01589	338 aa		0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YLR296W	Q05898	108 aa		0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	MED11	Q99278	115 aa		0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	SPP41	P38904	1435 aa		0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YMR122C	Q03879	124 aa		0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	RTR2	Q12378	196 aa		0.96	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	COX23	P38824	151 aa		0.95	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YIL102C	P40488	101 aa		0.95	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	PCC1	Q3E833	88 aa		0.95	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	HAP1	P0CE41	1502 aa		0.95	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YCR099C	P25657	155 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	COA4	Q05809	96 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	KTI11	Q3E840	82 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	RPO31	P04051	1460 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	DNF2	Q12675	1612 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	TRM732	Q03496	1420 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YER187W	P40102	141 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	FYV7	Q12247	151 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	BNI1	P41832	1953 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	PAU19	P0CE85	124 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	PAU3	P25610	124 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	HPA2	Q06592	156 aa		0.94	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YAR064W	P39563	99 aa		0.93	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YEA6	P39953	335 aa		0.93	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	CYB5	P40312	120 aa		0.93	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	LCL2	Q08045	131 aa		0.93	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	CCW12	Q12127	133 aa		0.93	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	MIC10	Q96VH5	97 aa		0.93	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	NTE1	Q04958	1679 aa		0.93	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YIL163C	P40448	117 aa		0.93	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	TY4B-J	P47024	1803 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YIR020C	P40575	100 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	OST5	Q92316	86 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	MYO1	P08964	1928 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	BUD3	P25558	1636 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	DOP1	Q03921	1698 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YPK9	Q12697	1472 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YRF1-6	P53819	1859 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	SRX1	P36077	127 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YBR013C	P38215	129 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	SNN1	P48232	102 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	MIC27	P50945	234 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	SSN2	P38931	1420 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	SPO14	P36126	1683 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	HUA1	P40325	198 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YOR072W	Q08486	104 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	DAD1	Q12248	94 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	TSC11	P40061	1430 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	MMS1	Q06211	1407 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
STB4	YMR019W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STB4	YMR019W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		0.9	□□□□□ -2.27

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