RNA–Protein interactions for RNA: YJL217W

REE1, Transcript of Cytoplasmic protein involved in the regulation of enolase (ENO1), yeast

Gene REE1, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REE1	YJL217W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		2.8	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	RPL39	P04650	51 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	PAU19	P0CE85	124 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	PAU21	P0CE86	164 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	PAU22	P0CE87	164 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	LDB16	P25587	256 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	PAU3	P25610	124 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	SCM4	P32564	187 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	YHR125W	P38831	101 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	CTR2	P38865	189 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	YFL051C	P43552	160 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	PAU5	P43575	122 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	YJR015W	P47090	510 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	DSK2	P48510	373 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	SIP18	P50263	79 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	UPS1	Q05776	175 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	NAT3	Q06504	195 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	HRD1	Q08109	551 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	DGA1	Q08650	418 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	BOL1	Q3E793	110 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	IRA1	P18963	3092 aa		2.79	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		2.78	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	QCR9	P22289	66 aa		2.78	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	YGL010W	P25338	174 aa		2.78	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	YKL102C	P34249	101 aa		2.78	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	PAM17	P36147	197 aa		2.78	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	OST2	P46964	130 aa		2.78	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	ERV14	P53173	138 aa		2.78	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	SHH3	Q04487	196 aa		2.78	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		2.78	□□□□□ -1.96
REE1	YJL217W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		2.77	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	FUN14	P18411	198 aa		2.77	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	HSP10	P38910	106 aa		2.77	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	PIR5	P46999	287 aa		2.77	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YOL014W	Q08110	124 aa		2.77	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		2.77	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	MRPL44	P19956	98 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	BET1	P22804	142 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	VMA11	P32842	164 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	CPR5	P35176	225 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YKR045C	P36138	183 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	CSH1	P38287	376 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	GPI2	P46961	280 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	MIC27	P50945	234 aa		2.76	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	MIG1	P27705	504 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	SRP21	P32342	167 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YBR220C	P38318	560 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YER134C	P40081	178 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
REE1	YJL217W	TOM7	P53507	60 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	APS2	Q00381	147 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YPL067C	Q02754	198 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		2.75	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	Q0255	P03881	472 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	FZF1	P32805	299 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YHL037C	P38733	133 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	CYB5	P40312	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	SED1	Q01589	338 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	RAV2	Q03956	351 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YOR105W	Q08504	108 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YOR268C	Q08734	132 aa		2.74	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YKR032W	P36127	104 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	POP7	P38291	140 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YER188W	P40103	239 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YIL059C	P40520	121 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	CSI2	Q08054	341 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	NAT5	Q08689	176 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	FIT2	Q08906	153 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	FCY1	Q12178	158 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	ATO3	Q12359	275 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		2.73	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	RPS23B	P0CX30	145 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	ATP15	P21306	62 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YHR173C	P38864	112 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	RPB11	P38902	120 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	LST8	P41318	303 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	YDR274C	P87283	123 aa		2.72	□□□□□ -1.97
REE1	YJL217W	IRC23	Q08416	157 aa		2.72	□□□□□ -1.97

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