RNA–Protein interactions for RNA: YDL084W

SUB2, Transcript of Component of the TREX complex required for nuclear mRNA export, yeast

Gene SUB2, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUB2	YDL084W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	APC1	P53886	1748 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	HUR1	P45820	110 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	NRM1	P53718	249 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	USV1	Q12132	391 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	RRT15	Q3E811	62 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	LAA1	P39526	2014 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	RPB9	P27999	122 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YKR045C	P36138	183 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YPT10	P38146	199 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	FZF1	P32805	299 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	SDH3	P33421	198 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YAL064W	P39711	94 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YER135C	P40082	130 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YNL217W	P40152	326 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	SIM1	P40472	476 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	NPC2	Q12408	173 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	MAK31	P23059	88 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	GPX1	P36014	167 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YAR068W	P39564	161 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	RSM18	P40033	138 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	FLO11	P08640	1367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	IMP1	P28627	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YFL019C	P43576	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YOL014W	Q08110	124 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YEL045C	P32616	141 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	PET8	P38921	284 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	ICY1	Q04329	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	TIM9	O74700	87 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YKL044W	P36092	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YHL005C	P38752	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	PIR1	Q03178	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YHP1	Q04116	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YER187W	P40102	141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	LPP1	Q04396	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YCR041W	P37265	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	CIS3	P47001	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	ICS3	P47034	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	AYT1	Q12226	474 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YEL028W	P39989	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	BOL2	P53082	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SUB2	YDL084W	MDM35	O60200	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PBA1	Q05778	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PMD1	P32634	1753 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	YCR043C	P25361	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	RNQ1	P25367	405 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	FYV5	P25585	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PAU2	P32612	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PAU13	P38725	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	YHR180W	P38868	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	VPS55	P47111	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PAU4	P53427	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PAU10	Q03050	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	MET31	Q03081	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PAU20	Q08322	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	NUP192	P47054	1683 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	YKR073C	P36153	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	NCA3	P46955	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	YGL118C	P53132	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	IGO1	P53897	168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	YDR274C	P87283	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	MIX17	Q03667	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SUB2	YDL084W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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