RNA–Protein interactions for RNA: YNL235C

YNL235C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL235C, Length 432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL235C	YNL235C	NSG1	P38837	291 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YEL028W	P39989	153 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	SPC25	P40014	221 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	SBH2	P52871	88 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	MET31	Q03081	177 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YOR015W	Q12169	119 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	OCA6	Q12454	224 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	QCR2	P07257	368 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	AHT1	P29589	182 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	AME1	P38313	324 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YBR242W	P38331	238 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	RFC2	P40348	353 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YIR020C	P40575	100 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YGL235W	P53071	178 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	HSK3	P69852	69 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	NKP2	Q06162	153 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YPR202W	Q08993	238 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	STF2	P16965	84 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	UGX2	P32772	223 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YFL051C	P43552	160 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	GAL83	Q04739	417 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	SWC7	Q06707	132 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YPR203W	Q08994	102 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	DAS2	Q12084	232 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	QCR6	P00127	147 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	SEN2	P16658	377 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	FES1	P38260	290 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	SLM6	P38343	150 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	AIM18	P38884	321 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	TTI2	P47168	421 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	THI74	Q04083	370 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	MIX14	Q04341	121 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	RIM9	Q04734	239 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	RAF1	Q06891	181 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	ATP20	Q12233	115 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YBL010C	P32788	280 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	RRT1	P38192	103 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YIL102C	P40488	101 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	VPS28	Q02767	242 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	PLP1	Q04004	230 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	UIP4	Q08926	304 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	RTR2	Q12378	196 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	RDI1	Q12434	202 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	AUA1	P32450	94 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	DER1	P38307	211 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	APS3	P47064	194 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	YKR005C	Q02203	525 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	YPR127W	Q06494	345 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	YLR053C	Q12026	108 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	YOR214C	Q12282	236 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	PET20	Q99373	253 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	HSP30	P25619	332 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	PTC1	P35182	281 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	YFR035C	P43608	114 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	YGL101W	P53144	215 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	ORM1	P53224	222 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	TIM13	P53299	105 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	YDR476C	Q03362	224 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	MAK3	Q03503	176 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	FIT1	Q04433	528 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	UPS1	Q05776	175 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	RAD6	P06104	172 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.81	□□□□□ -2.28	not detected
YNL235C	YNL235C	MPM1	P40364	252 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	APQ12	P40532	138 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	NSE4	P43124	402 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	SIP18	P50263	79 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	HHT1	P61830	136 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	SED1	Q01589	338 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	YHP1	Q04116	353 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YNL235C	YNL235C	ETR1	P38071	380 aa		0.8	□□□□□ -2.28

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.1 ms