RNA–Protein interactions for RNA: YKL223W

YKL223W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKL223W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL223W	YKL223W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	RAF1	Q06891	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	FIT2	Q08906	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	VPS63	O13549	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	API2	Q04413	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	HNT3	Q08702	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	GRE1	Q08969	168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	PHO85	P17157	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	YMR31	P19955	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	HSP150	P32478	413 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	YIL089W	P40500	205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	PRY1	P47032	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL223W	YKL223W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	IMP1	P28627	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	VMA11	P32842	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	PET8	P38921	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	TOM7	P53507	60 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	COX12	Q01519	83 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	UBC7	Q02159	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YHP1	Q04116	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	ENV10	Q99382	181 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YLR415C	O13578	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YCR085W	P25650	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	REC104	P33323	182 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	MID2	P36027	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
YKL223W	YKL223W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	HUA1	P40325	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	LST8	P41318	303 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	SHR5	P41912	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	CWP2	P43497	92 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YGR039W	P53225	103 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	PCP1	P53259	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	ABF2	Q02486	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	TRS23	Q03784	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	UBC5	P15732	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	GPI18	P38211	433 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YEL067C	P39978	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	OSW5	P40219	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YIL059C	P40520	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YIL029C	P40538	142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YNR077C	P53758	84 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	UPS1	Q05776	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	RRG8	Q06109	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YKR032W	P36127	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	NCA3	P46955	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	MGR2	Q02889	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	Q0255	P03881	472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	MXR2	P25566	168 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	RPS27B	P38711	82 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YNL217W	P40152	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	HST4	P53688	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	MIX14	Q04341	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	FCY1	Q12178	158 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	ECM12	O13529	151 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	TIR2	P33890	251 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YKL070W	P36087	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YKR073C	P36153	106 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	FIP1	P45976	327 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	LCB3	P47013	409 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	BNA1	P47096	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	YIP1	P53039	248 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	HSK3	P69852	69 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL223W	YKL223W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
YKL223W	YKL223W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL223W	YKL223W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL223W	YKL223W	YHR140W	P38842	239 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL223W	YKL223W	YER085C	P40058	173 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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