RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	LCB3	P47013	409 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	TDA4	P47153	279 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	UBC7	Q02159	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	IZH1	Q03419	316 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	SRL1	Q08673	210 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YLR415C	O13578	112 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	CAB4	P53332	305 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	RPB9	P27999	122 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	AME1	P38313	324 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	MIC12	P38341	106 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YER134C	P40081	178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	VPS55	P47111	140 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	TOS8	P53147	276 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	TRI1	Q05024	226 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YPR013C	Q12145	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	DAD1	Q12248	94 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	NUM1	Q00402	2748 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	DIF1	O13577	133 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	ZRT1	P32804	376 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YCR041W	P37265	110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	SPG4	Q04438	115 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	CMC1	P36064	111 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	MST28	P39552	234 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	MST27	P53176	234 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YGR017W	P53210	297 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	HOR7	Q05827	59 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	ERV14	P53173	138 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	CAX4	P53223	239 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	DUG3	P53871	357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	CSM4	Q08955	156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	CPT1	P17898	393 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	SCM4	P32564	187 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YPT53	P36019	220 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	SNF11	P38956	169 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YPI1	P43587	155 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	RPA43	P46669	326 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	COA6	Q3E846	104 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	PAU7	P39545	55 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YER188W	P40103	239 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YJL028W	P47062	111 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	ATG39	Q06159	398 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	ATG33	Q06485	197 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	GEP3	Q08622	556 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	MDM10	P18409	493 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	FUN14	P18411	198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YNL194C	P40169	301 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	FIP1	P45976	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	GTO3	Q04806	366 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	PRM7	Q12459	698 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	CDC43	P18898	376 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	TEM1	P38987	245 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	BRP1	P53194	125 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YOL085C	Q99345	113 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	CCW14	O13547	238 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YCL042W	P25572	119 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YKR032W	P36127	104 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	PET8	P38921	284 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	SPI1	P40092	148 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	POM33	Q12164	279 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	YGL118C	P53132	145 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	TIM22	Q12328	207 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YCK1	YHR135C	MRPL44	P19956	98 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YHR022C	P38763	256 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	SIM1	P40472	476 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YIP3	P53633	176 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	UPS3	Q04006	179 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	GPI19	Q04082	140 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	IZH3	Q07959	543 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66

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