RNA–Protein interactions for RNA: YGR065C

VHT1, Transcript of High-affinity plasma membrane H+-biotin (vitamin H) symporter, yeast

Gene VHT1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHT1	YGR065C	YGR164W	P53291	111 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	HSK3	P69852	69 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	ERG2	P32352	222 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	MRPS5	P33759	307 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	YHR140W	P38842	239 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	MRX11	Q03079	207 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	IRC25	Q07951	179 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	YCR006C	P25350	157 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	YPS1	P32329	569 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	REC104	P33323	182 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	GPI18	P38211	433 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	SVP26	P38869	228 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	MCH4	Q08268	501 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	YPS3	Q12303	508 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
VHT1	YGR065C	YGR269W	P40326	108 aa		5	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		5	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	SMP1	P38128	452 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	YPL073C	P40323	161 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	CIS3	P47001	227 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	VPS55	P47111	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	SDS23	P53172	527 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	OM14	P38325	134 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	CDC1	P40986	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	ROT1	Q03691	256 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	MIM1	Q08176	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	MRS3	P10566	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	FZF1	P32805	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	REC114	P32841	428 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	APS1	P35181	156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	Q0255	P03881	472 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	USV1	Q12132	391 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	VMA3	P25515	160 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	IMP1	P28627	190 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	SRX1	P36077	127 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	PEX22	P39718	180 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	MST27	P53176	234 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	SUT2	Q12286	268 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	FLO9	P39712	1322 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VHT1	YGR065C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	SFT2	P38166	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	YAR029W	P39549	74 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	FIP1	P45976	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	GAT3	Q07928	141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	RPP1	P38786	293 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	MBB1	P39534	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	TIM18	Q08749	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	MET32	Q12041	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	IES6	P32617	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	RRT13	P40042	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	LST8	P41318	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	CSH1	P38287	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	YPI1	P43587	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	DSE2	P38844	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	SHH4	Q06236	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	BET1	P22804	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	TIM12	P32830	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
VHT1	YGR065C	RLM1	Q12224	676 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	YLR302C	O13544	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	UBC4	P15731	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	GGC1	P38988	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	YFR054C	P43622	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	JJJ3	P47138	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	VEL1	P53058	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
VHT1	YGR065C	ATP19	P81451	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	HAL1	Q01766	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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