RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	RRT1	P38192	103 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	GON7	P46984	123 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	MPC3	P53311	146 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	SHH3	Q04487	196 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YFR045W	P43617	309 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YNR064C	P53750	290 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	RRT7	Q07829	113 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	SAS5	Q99314	248 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	MRPL15	P36523	253 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YEL073C	P39974	107 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	GAT4	P40569	121 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	NUM1	Q00402	2748 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	DIE2	P50076	525 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	SEC59	P20048	519 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YCR050C	P25630	102 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	AIM18	P38884	321 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	SPG1	P50088	95 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	LIP1	Q03579	150 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YOR268C	Q08734	132 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	MDH2	P22133	377 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	MID2	P36027	376 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YBR090C	P38253	122 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YAR029W	P39549	74 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YPR063C	Q12160	140 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	MSW1	P04803	379 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YMR252C	Q04814	134 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	SML1	Q04964	104 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	SDH4	P37298	181 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	ATG10	Q07879	167 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	PAM17	P36147	197 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	GAA1	P39012	614 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	DOC1	P53068	250 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YOL162W	P0CF19	215 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YNL217W	P40152	326 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	SAY1	P53324	424 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	HAL1	Q01766	294 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	COA4	Q05809	96 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	CSI2	Q08054	341 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	SCS22	Q6Q595	175 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YKR032W	P36127	104 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	TVP23	P38962	199 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YEA6	P39953	335 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	PAM16	P42949	149 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	RIM9	Q04734	239 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	UPS1	Q05776	175 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	FZF1	P32805	299 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YAL064W	P39711	94 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	UBC5	P15732	148 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	YDR416W	YIR035C	P40579	254 aa		3.03	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	NSE4	P43124	402 aa		3.03	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YPI1	P43587	155 aa		3.03	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	PIN3	Q06449	215 aa		3.03	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.03	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	UBR1	P19812	1950 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	SRL3	P36167	246 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YHR180W	P38868	163 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	FLX1	P40464	311 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	RCE1	Q03530	315 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YHL042W	P38729	150 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	IRC23	Q08416	157 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YLR422W	Q06409	1932 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YET1	P35723	206 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	GRX5	Q02784	150 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	NHP10	Q03435	203 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YMR103C	Q04436	120 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	UIP4	Q08926	304 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		3	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	ERV15	P38312	142 aa		3	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YNR077C	P53758	84 aa		3	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	ATP19	P81451	68 aa		3	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	KEI1	Q06346	221 aa		3	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	MED11	Q99278	115 aa		3	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YCR099C	P25657	155 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	MIG1	P27705	504 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YGR164W	P53291	111 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YOR385W	Q08909	290 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YOR015W	Q12169	119 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	SCM4	P32564	187 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YGL260W	P53056	76 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	ATG40	Q99325	256 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93

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