RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A YGL235WP53071 178 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YNL033WP53964 284 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A CDC14Q00684 551 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A MPD1Q12404 318 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A TOR1P35169 2470 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A MBF1O14467 151 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A ECM31P38122 312 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A BNA7Q04066 261 aa-0.79□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A PFY1P07274 126 aa-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A ADE1P27616 306 aa-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A OCH1P31755 480 aa-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YUH1P35127 236 aa-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A SMB1P40018 196 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A SER2P42941 309 aa-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A BRX1Q08235 291 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A COX19Q3E731 98 aa-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YBR072C-AQ3E794 53 aa-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A UBR1P19812 1950 aa-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A CDC33P07260 213 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A NBP35P52920 328 aa-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A LSB1P53281 241 aa-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A GRX8Q05926 109 aa-0.8□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A ARC19P33204 171 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A RIB7P33312 244 aa-0.81□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A RPC17P47076 161 aa-0.81□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YLR283WQ05867 314 aa-0.81□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A GIS3Q12418 502 aa-0.81□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A SRP14P38985 146 aa-0.81□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A EST3Q03096 181 aa-0.81□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YML079WQ03629 201 aa-0.81□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YPR203WQ08994 102 aa-0.81□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A MSH5Q12175 901 aa-0.81□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A ADK1P07170 222 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A STE18P18852 110 aa-0.81□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A RRT8Q08219 342 aa-0.81□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A DDR48P18899 430 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YBL010CP32788 280 aa-0.82□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A ALG13P53178 202 aa-0.82□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YNL134CP53912 376 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A SAC3P46674 1301 aa-0.82□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YBR121C-AP0C5L4 52 aa-0.82□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A ANB1P19211 157 aa-0.82□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A UTP30P36144 274 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YBR242WP38331 238 aa-0.82□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A MRPS12P53732 153 aa-0.82□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YMR321CQ04898 105 aa-0.82□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YOR015WQ12169 119 aa-0.82□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A RPB3P16370 318 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A HHY1P39982 102 aa-0.83□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A SPC25P40014 221 aa-0.83□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A TAR1Q8TGM6 124 aa-0.83□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A COQ1P18900 473 aa-0.83□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A FES1P38260 290 aa-0.83□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A MCM22P47167 239 aa-0.83□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A UBC12P52491 188 aa-0.83□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A PET117Q02771 107 aa-0.83□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YOR385WQ08909 290 aa-0.83□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A Q0297Q9ZZV8 51 aa-0.83□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A FMC1P40491 155 aa-0.84□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YLR042CQ07990 161 aa-0.84□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YMR31P19955 123 aa-0.84□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A VPS21P36017 210 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A BRR6P53062 197 aa-0.84□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A EDC1P53080 175 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A CBF1P17106 351 aa-0.84□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A YDR476CQ03362 224 aa-0.84□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A MAK3Q03503 176 aa-0.84□□□□□ -2.54
YPL060C-AYPL060C-A MRS1P07266 363 aa-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A RME1P32338 300 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A PDS1P40316 373 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A CCC1P47818 322 aa-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A YNL190WP53872 204 aa-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A DML1Q03652 475 aa-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A KRE28Q04431 385 aa-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A RIM9Q04734 239 aa-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A SDO1Q07953 250 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A PGC1Q08959 321 aa-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A ASF2P32448 525 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A CBT1P36038 271 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A YEL014CP39999 101 aa-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A NSA2P40078 261 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A RPA43P46669 326 aa-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A NQM1P53228 333 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A YOR343CQ12484 108 aa-0.85□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A PHO13P19881 312 aa-0.86□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A IPI1P38803 334 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A FIT3Q08907 204 aa-0.86□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A SEN15Q04675 128 aa-0.86□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A ATG41Q12048 136 aa-0.86□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A OCA6Q12454 224 aa-0.86□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A YML054C-AQ3E809 52 aa-0.86□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A RIB3Q99258 208 aa-0.86□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A MER1P16523 270 aa-0.86□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A YGL193CP53097 103 aa-0.86□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A YPR153WQ06537 140 aa-0.86□□□□□ -2.55
YPL060C-AYPL060C-A CSM4Q08955 156 aa-0.86□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 130.4 ms