RNA–Protein interactions for RNA: YLR454W

FMP27, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene FMP27, Length 7,887 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FMP27	YLR454W	YIP1	P53039	248 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	YGR168C	P53293	376 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	COS6	P53344	381 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	HCH1	P53834	153 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	EST3	Q03096	181 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	LOA1	Q06508	300 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	RTN2	Q12443	393 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	HIS3	P06633	220 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	PET54	P10834	293 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	CCA1	P21269	546 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.28	□□□□□ -2.36	not detected
FMP27	YLR454W	PAU24	P38155	120 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	OTU1	P43558	301 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	ATC1	Q04005	294 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	KEI1	Q06346	221 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	CRC1	Q12289	327 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	RNH203	Q12338	110 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	PRM4	Q12498	284 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	HTB2	P02294	131 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	YPI1	P43587	155 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	ATG17	Q06410	417 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	YPL264C	Q08980	353 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	DCN1	Q12395	269 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	CDC34	P14682	295 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	SNC2	P33328	115 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	MIT1	P40002	666 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	JLP2	P40206	208 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	DAN1	P47178	298 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	ASR1	Q06834	288 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	RTC6	O14464	93 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	YBR085C-A	O43137	85 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	SEC59	P20048	519 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	DOG2	P38773	246 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	DOG1	P38774	246 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	CTF8	P38877	133 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	MST28	P39552	234 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	LST8	P41318	303 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	YJR015W	P47090	510 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	HST4	P53688	370 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	FRQ1	Q06389	190 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	LCL2	Q08045	131 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	FCY1	Q12178	158 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	ATR1	P13090	542 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	NTG1	P31378	399 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	MBA1	P38300	278 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	YEA6	P39953	335 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	YJR056C	P47115	236 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FMP27	YLR454W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	CAP2	P13517	287 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	YGL010W	P25338	174 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	HOT13	P36078	116 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	QDR3	P38227	689 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	GEP4	P38812	185 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	LCB3	P47013	409 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	IRC18	P47056	224 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	NIF3	P53081	288 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	VOA1	P53262	265 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	ASI3	P53983	676 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	MRPS16	Q02608	121 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	NNT1	Q05874	261 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	YPD1	Q07688	167 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	ATX2	Q12067	313 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	YCR043C	P25361	127 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	MRPS9	P38120	278 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	YER134C	P40081	178 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	SGF11	Q03067	99 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	SDH7	Q04401	133 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	NDL1	Q06568	189 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	MIC10	Q96VH5	97 aa		0.28	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	UBC5	P15732	148 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	AGA1	P32323	725 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	SNF11	P38956	169 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
FMP27	YLR454W	UBC11	P52492	156 aa		0.27	□□□□□ -2.37

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 89.9 ms