RNA–Protein interactions for RNA: YJL115W

ASF1, Transcript of Nucleosome assembly factor, yeast

Gene ASF1, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ASF1	YJL115W	EMC5	P40540	141 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ASF1	YJL115W	LCB3	P47013	409 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ASF1	YJL115W	MCM22	P47167	239 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ASF1	YJL115W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ASF1	YJL115W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ASF1	YJL115W	NRG2	P38082	220 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	AIM24	P47127	394 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	DSK2	P48510	373 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	GNP1	P48813	663 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	ADD37	Q03233	198 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	YMR244W	Q04018	355 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	LOA1	Q06508	300 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	MED7	Q08278	222 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	YOL160W	Q08321	113 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	TMA17	Q12513	150 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	SHG1	P38337	142 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	MBB1	P39534	108 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	SNX4	P47057	423 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	YGR025W	P53216	100 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	MRX11	Q03079	207 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	MRPS8	Q03799	155 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	STP4	Q07351	490 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	FIT2	Q08906	153 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	YPR063C	Q12160	140 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	YER135C	P40082	130 aa		5	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	PHO23	P50947	330 aa		5	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	YCL001W-A	P87012	153 aa		5	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	ERV2	Q12284	196 aa		5	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	HMX1	P32339	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	TRS20	P38334	175 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	VMA22	P38784	181 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	ATX2	Q12067	313 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	CYC7	P00045	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	MRS1	P07266	363 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	AFR1	P33304	620 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	MIG3	P39943	394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	SPC25	P40014	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	PAU4	P53427	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	TMA23	Q03525	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	RIB5	P38145	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	YHR173C	P38864	112 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	COX19	Q3E731	98 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ASF1	YJL115W	HTB2	P02294	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	YHR022C	P38763	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	YFR035C	P43608	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	YJR096W	P47137	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	TOM7	P53507	60 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	CCW12	Q12127	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	PAU13	P38725	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	HAL1	Q01766	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	PAU10	Q03050	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	SGF11	Q03067	99 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	RAV2	Q03956	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	PAU20	Q08322	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	YCR001W	P25347	104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	MSK1	P32048	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	YLR302C	O13544	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	CPT1	P17898	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	HUA1	P40325	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	SNN1	P48232	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	DAD1	Q12248	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	VMA7	P39111	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	CYB5	P40312	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	KEG1	P43614	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	DAD4	P69851	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	COA4	Q05809	96 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	VAM10	Q08474	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	FMP16	Q12497	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ASF1	YJL115W	ECM25	P32525	599 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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