RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HCA4	YJL033W	VAR1	P02381	398 aa		3.2	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	CTA1	P15202	515 aa		3.2	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	AHT1	P29589	182 aa		3.2	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	TIM12	P32830	109 aa		3.2	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	CMC1	P36064	111 aa		3.2	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	DPP1	Q05521	289 aa		3.2	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	MSB2	P32334	1306 aa		3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YCR022C	P25620	114 aa		3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YKL071W	P36086	256 aa		3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YLR460C	P54007	376 aa		3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	GTO3	Q04806	366 aa		3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	ZRT1	P32804	376 aa		3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	RPS27B	P38711	82 aa		3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YML079W	Q03629	201 aa		3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	ECM18	Q04623	453 aa		3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	UBA3	Q99344	299 aa		3.19	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	TRA1	P38811	3744 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	FCY2	P17064	533 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	AGA1	P32323	725 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	ATX1	P38636	73 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	SUR7	P54003	302 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YDR102C	Q03864	110 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	LPP1	Q04396	274 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	BLM10	P43583	2143 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	GAL7	P08431	366 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	MDH2	P22133	377 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	OXA1	P39952	402 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	PET191	Q02772	108 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YPL039W	Q03080	316 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	RIM9	Q04734	239 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YPR098C	Q06089	161 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YPL229W	Q99395	206 aa		3.18	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	COX10	P21592	462 aa		3.17	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	HSP150	P32478	413 aa		3.17	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YOR062C	P36025	268 aa		3.17	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YHR180W	P38868	163 aa		3.17	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	OST2	P46964	130 aa		3.17	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	SDH7	Q04401	133 aa		3.17	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	OPI3	P05375	206 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	CUP2	P15315	225 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	ERG2	P32352	222 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	TIR2	P33890	251 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	ECM14	P38836	430 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	SRP14	P38985	146 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	GPI2	P46961	280 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YGL235W	P53071	178 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YLR152C	P54072	576 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	ATG40	Q99325	256 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.16	□□□□□ -1.9	not detected
HCA4	YJL033W	SRX1	P36077	127 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	MIC27	P50945	234 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YIP5	P53108	310 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	CRH1	P53301	507 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	JID1	Q12350	301 aa		3.16	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	MRS1	P07266	363 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YER085C	P40058	173 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YIL163C	P40448	117 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	TDA4	P47153	279 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	SBH2	P52871	88 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	LIP2	Q06005	328 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
HCA4	YJL033W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCA4	YJL033W	HMRA1	P0CY11	126 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCA4	YJL033W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
HCA4	YJL033W	MIC12	P38341	106 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCA4	YJL033W	SAS2	P40963	338 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCA4	YJL033W	YGL118C	P53132	145 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCA4	YJL033W	YIP3	P53633	176 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCA4	YJL033W	VPS71	Q03433	280 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCA4	YJL033W	DGA1	Q08650	418 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HCA4	YJL033W	QCR9	P22289	66 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HCA4	YJL033W	REC114	P32841	428 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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