RNA–Protein interactions for RNA: YFR006W

YFR006W, Transcript of Putative X-Pro aminopeptidase, yeast

Gene YFR006W, Length 1,608 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YFR006W	YFR006W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	AYT1	Q12226	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	ECM12	O13529	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TIM9	O74700	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	YBR013C	P38215	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	YAL064W	P39711	94 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	ATG18	P43601	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	YNR064C	P53750	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	RAF1	Q06891	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	ODC2	Q99297	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	YKR073C	P36153	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	FLO5	P38894	1075 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	NDD1	Q08887	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	SMC4	Q12267	1418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
YFR006W	YFR006W	DSK2	P48510	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	YGL118C	P53132	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	YDR115W	Q04598	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	ATP20	Q12233	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	HOT13	P36078	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	UMP1	P38293	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	ERG25	P53045	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	COA6	Q3E846	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YFR006W	YFR006W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	FLX1	P40464	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	PIR5	P46999	287 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	LIP1	Q03579	150 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	TVP15	Q03860	143 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	UPS3	Q04006	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	HRT1	Q08273	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	RPR2	P40571	144 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	PIN3	Q06449	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	GPI18	P38211	433 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	KNH1	P50112	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	API2	Q04413	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	RIM9	Q04734	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	CSI2	Q08054	341 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	MYO4	P32492	1471 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	INO4	P13902	151 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	YHL042W	P38729	150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	CTR2	P38865	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	SEN15	Q04675	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	PAN1	P32521	1480 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	YEL073C	P39974	107 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	CYB5	P40312	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	NUP159	P40477	1460 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	YIL054W	P40524	105 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	FUN14	P18411	198 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	RRT1	P38192	103 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	SNF11	P38956	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	EMC5	P40540	141 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	CAX4	P53223	239 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	SWR1	Q05471	1514 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	YKL044W	P36092	106 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	SWD3	P38123	315 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	TDA2	P40045	126 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	YFL065C	P43539	102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	YPR203W	Q08994	102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	MAK31	P23059	88 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	DNA2	P38859	1522 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YFR006W	YFR006W	SRB8	P25648	1427 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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