RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W AFR1P33304 620 aa7.6□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W BDH1P39714 382 aa7.6□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W DSK2P48510 373 aa7.6□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W MGA1P53050 456 aa7.6□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W YGR026WP53217 278 aa7.6□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W LST7P53237 242 aa7.6□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W MCH1Q07376 486 aa7.6□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W FCY1Q12178 158 aa7.6□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W RKI1Q12189 258 aa7.6□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W PET494P07390 489 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W YCR022CP25620 114 aa7.59□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W MIA40P36046 403 aa7.59□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W BNA1P47096 177 aa7.59□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W YGR018CP53211 109 aa7.59□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W TMA10Q06177 86 aa7.59□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W LOA1Q06508 300 aa7.59□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W GEP5Q12393 293 aa7.59□□□□□ -1.19
BRR1YPR057W PHO85P17157 305 aa7.58□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W POF1P25576 258 aa7.58□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W HMX1P32339 317 aa7.58□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W IMD2P38697 523 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W YFL054CP43549 646 aa7.58□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W LDS2Q08218 356 aa7.58□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data7.57□□□□□ -1.2not detected
BRR1YPR057W RNA15P25299 296 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W RPS2P25443 254 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W CDS1P38221 457 aa7.57□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W HSP10P38910 106 aa7.57□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W CYB5P40312 120 aa7.57□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W NHP6AP11632 93 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W AVT5P38176 459 aa7.56□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W PRE3P38624 215 aa7.56□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W GPI2P46961 280 aa7.56□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W ATG27P46989 271 aa7.56□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W YMR317WQ04893 1140 aa7.56□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W YBR013CP38215 129 aa7.55□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W DOG2P38773 246 aa7.55□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W DOG1P38774 246 aa7.55□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W HIT1P46973 164 aa7.55□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W DAD3P69850 94 aa7.55□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W SDH7Q04401 133 aa7.55□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W YOR352WQ08816 343 aa7.55□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W YOP1Q12402 180 aa7.55□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W CDC7P06243 507 aa7.54□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W HSP12P22943 109 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W SFT2P38166 215 aa7.54□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W ICS2P38284 255 aa7.54□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W YNR071CP53757 342 aa7.54□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W FYV6P53913 173 aa7.54□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W RXT3Q07458 294 aa7.54□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W FMP49A0A023PZB3 126 aa7.53□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W RRT1P38192 103 aa7.53□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W GPP2P40106 250 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W STP4Q07351 490 aa7.53□□□□□ -1.2
BRR1YPR057W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W SRP21P32342 167 aa7.52□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W NNK1P36003 928 aa7.52□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W YHR173CP38864 112 aa7.52□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W YIL163CP40448 117 aa7.52□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W PAU5P43575 122 aa7.52□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W HST4P53688 370 aa7.52□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W OCA2P53949 197 aa7.52□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W YMR166CQ03829 368 aa7.52□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W NAT3Q06504 195 aa7.52□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W FIT2Q08906 153 aa7.52□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W BPH1P25356 2167 aa7.52□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W PHD1P36093 366 aa7.51□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W LSM2P38203 95 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W WWM1P43582 211 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W APS2Q00381 147 aa7.51□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W MRX11Q03079 207 aa7.51□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W AYT1Q12226 474 aa7.51□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W PAU19P0CE85 124 aa7.5□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W PAU21P0CE86 164 aa7.5□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W PAU22P0CE87 164 aa7.5□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W PAU3P25610 124 aa7.5□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W YPS1P32329 569 aa7.5□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W PIC2P40035 300 aa7.5□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W IRC23Q08416 157 aa7.5□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W DCN1Q12395 269 aa7.5□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W YHR213WP0CI67 198 aa7.49□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W FEN2P25621 512 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W GET2P40056 285 aa7.49□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W CPD1P53314 239 aa7.49□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W LAS17Q12446 633 aa7.49□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W DDI2P0CH63 225 aa7.48□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W DDI3P0CH64 225 aa7.48□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W SRP14P38985 146 aa7.48□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W SUR2P38992 349 aa7.48□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W MRS1P07266 363 aa7.47□□□□□ -1.21
BRR1YPR057W YGL010WP25338 174 aa7.47□□□□□ -1.21
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