RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	PAU3	P25610	124 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	AVT5	P38176	459 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	DER1	P38307	211 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YFL051C	P43552	160 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YJR015W	P47090	510 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	EOS1	P53938	366 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	CYT2	Q00873	224 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YHP1	Q04116	353 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	LIP2	Q06005	328 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	NAT3	Q06504	195 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	LOA1	Q06508	300 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	GAT3	Q07928	141 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	LDS2	Q08218	356 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	ATP10	P18496	279 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YMR31	P19955	123 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	SUR2	P38992	349 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YIL163C	P40448	117 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	PIR5	P46999	287 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	DSK2	P48510	373 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	ATP23	P53722	227 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	SHH3	Q04487	196 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YOP1	Q12402	180 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	VPS63	O13549	108 aa		4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YGL010W	P25338	174 aa		4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	PHD1	P36093	366 aa		4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	DAD2	P36162	133 aa		4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	HSP10	P38910	106 aa		4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	RPN14	P53196	417 aa		4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	BOR1	P53838	576 aa		4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	OCA2	P53949	197 aa		4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	POS5	Q06892	414 aa		4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	SCM4	P32564	187 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	CPR5	P35176	225 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YBR090C	P38253	122 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	VHS2	P40463	436 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	GPI2	P46961	280 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YGL260W	P53056	76 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	ERV14	P53173	138 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	CRZ1	P53968	678 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	API2	Q04413	109 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	ARR2	Q06597	130 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YPS3	Q12303	508 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	HMX1	P32339	317 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YBR220C	P38318	560 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	CTR2	P38865	189 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	HUA1	P40325	198 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	OST3	P48439	350 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	MIC27	P50945	234 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	DUG3	P53871	357 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	APS2	Q00381	147 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	SED1	Q01589	338 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	ATC1	Q04005	294 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	YDL218W	Q07629	317 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	GEP5	Q12393	293 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	PAM17	P36147	197 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	SRP14	P38985	146 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	IRC22	P40006	225 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	DCN1	Q12395	269 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TRS33	YOR115C	FUN14	P18411	198 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	MRPL44	P19956	98 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YCR007C	P25354	239 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	SRP21	P32342	167 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	SPS18	P32572	300 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YHL037C	P38733	133 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78

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