RNA–Protein interactions for RNA: YNR001C

CIT1, Transcript of Citrate synthase, yeast

Gene CIT1, Length 1,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIT1	YNR001C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	SPS18	P32572	300 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	CSE2	P33308	149 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YOX1	P34161	385 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YHL026C	P38740	315 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YER121W	P40076	114 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YJL213W	P40896	331 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	XPT1	P47165	209 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	TPC1	P53257	314 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	VPS28	Q02767	242 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YMR166C	Q03829	368 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	MCH1	Q07376	486 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YPL278C	Q08990	100 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	AKR2	Q12013	749 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	RAD28	Q12021	506 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	JID1	Q12350	301 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PAU1	P0CE88	120 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PAU14	P0CE89	120 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PAU6	P0CE90	120 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PAU18	P0CE91	120 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PAU8	P0CE92	120 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PAU11	P0CE93	120 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	TRX3	P25372	127 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YCR101C	P25607	182 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	IMP1	P28627	190 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PAU13	P38725	120 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	DOG1	P38774	246 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PHS1	P40857	217 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	BXI1	P48558	297 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	COQ5	P49017	307 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PAU4	P53427	120 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PDR17	P53844	350 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PAU10	Q03050	120 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	ADD37	Q03233	198 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	RCE1	Q03530	315 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YMR321C	Q04898	105 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	MRX8	Q05473	314 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	ATG10	Q07879	167 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PAU20	Q08322	120 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	ERV2	Q12284	196 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PAU9	Q3E770	120 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	ODC2	Q99297	307 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	DYN1	P36022	4092 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	MRP49	P32388	137 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PRY2	P36110	329 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YEA6	P39953	335 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	RFC2	P40348	353 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	EGT2	P42835	1041 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	OST3	P48439	350 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YGL235W	P53071	178 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	SDS23	P53172	527 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	CRH1	P53301	507 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YLR460C	P54007	376 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YPL067C	Q02754	198 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YMR253C	Q04835	414 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	SEI1	Q06058	285 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PAU23	Q07987	124 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YOL024W	Q08172	172 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	HNT3	Q08702	217 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	PAU17	Q12370	124 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	HUT1	Q12520	339 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	ECM29	P38737	1868 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CIT1	YNR001C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.92	not detected
CIT1	YNR001C	SLM6	P38343	150 aa		3.09	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	GGC1	P38988	300 aa		3.09	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	YIL152W	P40455	235 aa		3.09	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	YIL067C	P40514	678 aa		3.09	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	SBH2	P52871	88 aa		3.09	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	DAD3	P69850	94 aa		3.09	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	YMR252C	Q04814	134 aa		3.09	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	RRT7	Q07829	113 aa		3.09	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	MIM1	Q08176	113 aa		3.09	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIT1	YNR001C	FRM2	P37261	193 aa		3.08	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.7 ms