RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YMR166C	Q03829	368 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	MHR1	Q06630	226 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	RAX2	Q12465	1220 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	TAO3	P40468	2376 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YCR007C	P25354	239 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	COQ3	P27680	312 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	IES6	P32617	166 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	ZRT1	P32804	376 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YPT53	P36019	220 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.88	□□□□□ -1.95	not detected
RRP5	YMR229C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	HEM4	P06174	275 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	HSP150	P32478	413 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	TIR2	P33890	251 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YIL163C	P40448	117 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YNL165W	P53891	406 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	IGO1	P53897	168 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	SHH3	Q04487	196 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YMR253C	Q04835	414 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	SRL1	Q08673	210 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	BSC1	Q12140	328 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YIL086C	P40503	102 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YIL024C	P40543	189 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YPI1	P43587	155 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	TVP18	Q04767	167 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	GPI18	P38211	433 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	HAC1	P41546	238 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	TRS23	Q03784	219 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	GEP3	Q08622	556 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	PUT1	P09368	476 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	MDM10	P18409	493 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	BDH1	P39714	382 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YNR071C	P53757	342 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	EST3	Q03096	181 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	SEI1	Q06058	285 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	PMU1	P36069	295 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YNL195C	P40168	261 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	MID1	P41821	548 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	NRM1	P53718	249 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	PMD1	P32634	1753 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	MDH2	P22133	377 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YEL068C	P39977	110 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	LST7	P53237	242 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	SYM1	Q06563	197 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	IMP1	P28627	190 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	MRP49	P32388	137 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	SPS18	P32572	300 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	AVT5	P38176	459 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	ANS1	P38832	159 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YJL163C	P46996	555 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	GWT1	P47026	490 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	DAD4	P69851	72 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YMR082C	Q04276	118 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	HTB2	P02294	131 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	RPP1	P38786	293 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	VHS2	P40463	436 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YFR020W	P43600	232 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YFR054C	P43622	192 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YGR045C	P53229	120 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YOP1	Q12402	180 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	FIG2	P25653	1609 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	PAM17	P36147	197 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	RPS27B	P38711	82 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	DFG5	Q05031	458 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	POS5	Q06892	414 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.86	□□□□□ -1.95	not detected
RRP5	YMR229C	YOR343C	Q12484	108 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YBR013C	P38215	129 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	MRX11	Q03079	207 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	NNK1	P36003	928 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YIL152W	P40455	235 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	VAR1	P02381	398 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	PCL1	P24867	279 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YER134C	P40081	178 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	ATP23	P53722	227 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	DPP1	Q05521	289 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	TEM1	P38987	245 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YER181C	P40097	107 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	DUG3	P53871	357 aa		2.85	□□□□□ -1.95

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