RNA–Protein interactions for RNA: YMR089C

YTA12, Transcript of Mitochondrial inner membrane m-AAA protease component, yeast

Gene YTA12, Length 2,478 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YTA12	YMR089C	GTT2	Q12390	233 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	GGC1	P38988	300 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	COS10	P52924	374 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	VAR1	P02381	398 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	SMP1	P38128	452 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	IPT1	P38954	527 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	CFD1	P40558	293 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YJL213W	P40896	331 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	SFT1	P43682	97 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	TOD6	P34219	525 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	SPO73	P40031	143 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	FMP42	Q04991	504 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	VPS68	Q12016	184 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	MRPL15	P36523	253 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	CIS3	P47001	227 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	SPS2	P08459	502 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
YTA12	YMR089C	ECM34	P38728	170 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	RNH202	Q05635	350 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YPS3	Q12303	508 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	MED11	Q99278	115 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	BLM10	P43583	2143 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	SPT14	P32363	452 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	RIP-Chip
YTA12	YMR089C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	CHS7	P38843	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	AIM11	P87275	137 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	SPC3	Q12133	184 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	FCY1	Q12178	158 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	DGK1	Q12382	290 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	TIR1	P10863	254 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YOR062C	P36025	268 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	LPP1	Q04396	274 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	FSH2	Q05015	223 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	IMP1	P28627	190 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	LDS1	P31379	325 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YHR140W	P38842	239 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YER181C	P40097	107 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	APJ1	P53940	528 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	VPS28	Q02767	242 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	SEC59	P20048	519 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	RNQ1	P25367	405 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	TDA4	P47153	279 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	DIE2	P50076	525 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	TIM22	Q12328	207 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	SRP21	P32342	167 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	RNP1	P32385	249 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	YLR042C	Q07990	161 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YTA12	YMR089C	ATS1	P31386	333 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	PRM5	P40476	318 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	RPE1	P46969	238 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	BNS1	P50084	137 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	RSM27	P53305	110 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	TRP1	P00912	224 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	ZRT3	P34240	503 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	COA4	Q05809	96 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	SCP1	Q08873	200 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	BOL1	Q3E793	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	ATP5	P09457	212 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	SNM1	P40993	198 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YTA12	YMR089C	GPI2	P46961	280 aa		4.07	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.9 ms