RNA–Protein interactions for RNA: YKL079W

SMY1, Transcript of Kinesin-like myosin passenger-protein, yeast

Gene SMY1, Length 1,971 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMY1	YKL079W	YOR214C	Q12282	236 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SMY1	YKL079W	MDM35	O60200	86 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	ATP5	P09457	212 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	STP22	P25604	385 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	NUF2	P33895	451 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	FLX1	P40464	311 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YKR005C	Q02203	525 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YMR252C	Q04814	134 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YPR013C	Q12145	317 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	MRS4	P23500	304 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.89	□□□□□ -2.27	not detected
SMY1	YKL079W	YAP3	P38749	330 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	DLS1	P40366	167 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	CCC1	P47818	322 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	UBC7	Q02159	165 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	VPS28	Q02767	242 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	RIM9	Q04734	239 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	SPC2	Q04969	178 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	SYM1	Q06563	197 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	HRD1	Q08109	551 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YOR015W	Q12169	119 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	SEN2	P16658	377 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	HSP30	P25619	332 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	PTC1	P35182	281 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	MPM1	P40364	252 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	GLC8	P41818	229 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YDR102C	Q03864	110 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YER181C	P40097	107 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YFL065C	P43539	102 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YGL204C	P53089	101 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YGL193C	P53097	103 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	TIM8	P57744	87 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	HHT1	P61830	136 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YDL241W	Q07738	123 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	RFU1	Q08003	200 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	RAD6	P06104	172 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	PHO13	P19881	312 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YGR042W	P53227	271 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	FMN1	Q03778	218 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	UPS1	Q05776	175 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	RPB7	P34087	171 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	POP7	P38291	140 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	PIR1	Q03178	341 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	DML1	Q03652	475 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	CSN9	Q03981	162 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	TRM3	Q07527	1436 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YCL042W	P25572	119 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YEL073C	P39974	107 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	HPA3	P39979	161 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	NSE4	P43124	402 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	RAV2	Q03956	351 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YDR391C	Q04170	232 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YPR114W	Q06107	315 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YPD1	Q07688	167 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	INO4	P13902	151 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YHR140W	P38842	239 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	RCF2	P53721	224 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	EST3	Q03096	181 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YHP1	Q04116	353 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	ELP6	Q04868	273 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	ATG41	Q12048	136 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	RAD50	P12753	1312 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YHL042W	P38729	150 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YEL067C	P39978	195 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	YNR064C	P53750	290 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	CWC27	Q02770	301 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	RCE1	Q03530	315 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	LIP1	Q03579	150 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	UPS3	Q04006	179 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	RIF1	P29539	1916 aa		0.84	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	UBR1	P19812	1950 aa		0.84	□□□□□ -2.27
SMY1	YKL079W	MAK31	P23059	88 aa		0.84	□□□□□ -2.28
SMY1	YKL079W	SRP21	P32342	167 aa		0.84	□□□□□ -2.28
SMY1	YKL079W	HYM1	P32464	399 aa		0.84	□□□□□ -2.28
SMY1	YKL079W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.28
SMY1	YKL079W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.28
SMY1	YKL079W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.28

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