RNA–Protein interactions for RNA: YHR193C

EGD2, Transcript of Alpha subunit of the nascent polypeptide-associated complex (NAC), yeast

Gene EGD2, Length 525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EGD2	YHR193C	VPS28	Q02767	242 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	IZH1	Q03419	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	MGR3	Q04472	501 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	YCT1	Q12235	531 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	CRC1	Q12289	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	VHS2	P40463	436 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	AIM24	P47127	394 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	FCY2	P17064	533 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	SEC22	P22214	214 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	YKL162C	P36052	402 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	JLP2	P40206	208 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	SPC1	P46965	94 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	ODC1	Q03028	310 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	SNO1	Q03144	224 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	CCW12	Q12127	133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	AYT1	Q12226	474 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	SIT1	P39980	628 aa		4.05	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	YIL077C	P40508	320 aa		4.05	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	NIF3	P53081	288 aa		4.05	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
EGD2	YHR193C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TIR2	P33890	251 aa		4.04	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	SFT2	P38166	215 aa		4.04	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	YHR022C	P38763	256 aa		4.04	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	ERV2	Q12284	196 aa		4.04	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	YPL229W	Q99395	206 aa		4.04	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	MRPL4	P36517	319 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TOM7	P53507	60 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	PDR17	P53844	350 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	COA4	Q05809	96 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	ENV7	Q12003	364 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	YFL067W	P43537	175 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	ATG27	P46989	271 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	YJR096W	P47137	282 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	USV1	Q12132	391 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	RDI1	Q12434	202 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	POM34	Q12445	299 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	SUA5	P32579	426 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	ELF1	P36053	145 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	MRPL3	P36516	390 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	IES5	P40060	125 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	SER2	P42941	309 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	MIC27	P50945	234 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	YPS5	P53057	165 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	YNR071C	P53757	342 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	PBA1	Q05778	276 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	TRM13	Q12383	476 aa		4.01	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	DDI2	P0CH63	225 aa		4	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	DDI3	P0CH64	225 aa		4	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	PKP2	P53170	491 aa		4	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	COA2	Q3E823	68 aa		4	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	NPL6	P32832	435 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	PPQ1	P32945	549 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	PET100	P38958	111 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	SWM2	P40342	146 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	SAS2	P40963	338 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	YDL183C	P48569	320 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	BOR1	P53838	576 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	SHH3	Q04487	196 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	NKP1	Q12493	238 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	MBB1	P39534	108 aa		3.98	□□□□□ -1.77
EGD2	YHR193C	GPG1	P53130	126 aa		3.98	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.8 ms