RNA–Protein interactions for RNA: YDR223W

CRF1, Transcript of Transcriptional corepressor, yeast

Gene CRF1, Length 1,404 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CRF1	YDR223W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	FLO5	P38894	1075 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	ERG25	P53045	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	IZH1	Q03419	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	ANT1	Q06497	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	COA2	Q3E823	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	MRS4	P23500	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	RTS2	P40962	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	TAD2	P47058	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	VPS55	P47111	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	HOR7	Q05827	59 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YEA4	P40004	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	JAC1	P53193	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	HCH1	P53834	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	MSC3	Q05812	728 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	FPR2	P32472	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	UPS2	P35200	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YBL071C	P38185	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YIL024C	P40543	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	MRS3	P10566	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	STF2	P16965	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	TOS8	P53147	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	CPD1	P53314	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	CRC1	Q12289	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YPS1	P32329	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	HMX1	P32339	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	RRT1	P38192	103 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	DOG2	P38773	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	DOG1	P38774	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	VMA22	P38784	181 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YAR068W	P39564	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	CAB4	P53332	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YNR066C	P53752	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	PRM3	Q08931	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	PRR2	Q12310	699 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YCR025C	P25352	136 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	AVT5	P38176	459 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	RPA43	P46669	326 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YJR015W	P47090	510 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YGR219W	P53307	113 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	BOR1	P53838	576 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	YML122C	Q03207	126 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	IRC23	Q08416	157 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRF1	YDR223W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	ACP1	P32463	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	CSH1	P38287	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	YBR292C	P38357	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	FIP1	P45976	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	MIC27	P50945	234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	SDH7	Q04401	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	ATX2	Q12067	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	MIC12	P38341	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	BDH1	P39714	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	YNL194C	P40169	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	YGR269W	P40326	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	AGE2	P40529	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	EMC5	P40540	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	SNX4	P47057	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	LST7	P53237	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	BET5	Q03630	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	YHP1	Q04116	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	CYC3	P06182	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	QCR9	P22289	66 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	MSK1	P32048	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	YGR018C	P53211	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	ODC1	Q03028	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	SHH3	Q04487	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	SPO13	P23624	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	YCR022C	P25620	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CRF1	YDR223W	SHG1	P38337	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.8 ms