RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	YKL162C	P36052	402 aa		3.27	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	3.27	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	AGX1	P43567	385 aa		3.27	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	EST3	Q03096	181 aa		3.27	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	FSH2	Q05015	223 aa		3.27	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	COA2	Q3E823	68 aa		3.27	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	VPS63	O13549	108 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	SRY1	P36007	326 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	SLM6	P38343	150 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	SNX4	P47057	423 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YJR056C	P47115	236 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	CRH1	P53301	507 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	STD1	Q02794	444 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YPL264C	Q08980	353 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	ATO3	Q12359	275 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	ATG31	Q12421	196 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	FMP16	Q12497	93 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	VMA7	P39111	118 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	DFG10	P40526	253 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YGR050C	P53231	118 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	BET5	Q03630	159 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YMR082C	Q04276	118 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.25	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	AEP3	Q12089	606 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	FCY1	Q12178	158 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	RAX2	Q12465	1220 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YCR025C	P25352	136 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	RPB9	P27999	122 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	ECM31	P38122	312 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	MIG3	P39943	394 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YEA4	P40004	342 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	COX15	P40086	486 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	HCH1	P53834	153 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	PDR17	P53844	350 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	DYN2	Q02647	92 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YMR166C	Q03829	368 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	DCS1	Q06151	350 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	PRR2	Q12310	699 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	FCY2	P17064	533 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	PHO85	P17157	305 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YKR045C	P36138	183 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	UBC12	P52491	188 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	MCH1	Q07376	486 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YPS3	Q12303	508 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	ATP14	Q12349	124 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	JID1	Q12350	301 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	AGC1	Q12482	902 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	UPS2	P35200	230 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	WSS1	P38838	269 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YER188W	P40103	239 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	EMC5	P40540	141 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	LST8	P41318	303 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	ERG25	P53045	309 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	FYV6	P53913	173 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	FRQ1	Q06389	190 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	NDE2	Q07500	545 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLX1	YBR228W	CCW14	O13547	238 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YGR269W	P40326	108 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	VHS2	P40463	436 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YNR066C	P53752	436 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	ZRC1	P20107	442 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	AHT1	P29589	182 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	QDR3	P38227	689 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YBR292C	P38357	123 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YJR015W	P47090	510 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	SNN1	P48232	102 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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