RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	YPL253C	HPA3	P39979	161 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SPC25	P40014	221 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YER134C	P40081	178 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	MPM1	P40364	252 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	TDA4	P47153	279 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SOL1	P50278	321 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SBH1	P52870	82 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	MET31	Q03081	177 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YMR295C	Q03559	197 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	FUS2	Q05670	677 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	GRX8	Q05926	109 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YOL024W	Q08172	172 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	ATP20	Q12233	115 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	MEC1	P38111	2368 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SNF4	P12904	322 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YHL037C	P38733	133 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	AIM2	P39721	246 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	CUP9	P41817	306 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YGL235W	P53071	178 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SNO1	Q03144	224 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	VPS71	Q03433	280 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	UPS3	Q04006	179 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	ELP6	Q04868	273 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.15	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	MYO1	P08964	1928 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	STP22	P25604	385 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	AHC2	P25649	128 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	ARO7	P32178	256 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	RRT1	P38192	103 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	CSH1	P38287	376 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	PGA1	P53896	198 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	NRK1	P53915	240 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	AIM34	Q03673	198 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YDR391C	Q04170	232 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	RIM9	Q04734	239 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	GAL83	Q04739	417 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	AVO2	Q04749	426 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	DYN3	Q04949	312 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	UPS1	Q05776	175 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YLR031W	Q07978	186 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	LCL2	Q08045	131 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YPR203W	Q08994	102 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	DAS2	Q12084	232 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YOR015W	Q12169	119 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YOR342C	Q12182	319 aa		0.14	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	DYN1	P36022	4092 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YCR023C	P25351	611 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YKL102C	P34249	101 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	CLG1	P35190	452 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SFK1	P35735	353 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	ETR1	P38071	380 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YBR242W	P38331	238 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	NSG1	P38837	291 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YFL051C	P43552	160 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	CGR1	P53188	120 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	PIR1	Q03178	341 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YHP1	Q04116	353 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YLR036C	Q07986	203 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	DGK1	Q12382	290 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.13	□□□□□ -2.39	not detected
VIK1	YPL253C	STF2	P16965	84 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	ECM4	P36156	370 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	MRPL15	P36523	253 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	RFC2	P40348	353 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	NSE4	P43124	402 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	TTI2	P47168	421 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YIP3	P53633	176 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	DML1	Q03652	475 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YMR007W	Q03675	126 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	GPI17	Q04080	534 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	FIT1	Q04433	528 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SHH4	Q06236	168 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YPR127W	Q06494	345 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	ATG41	Q12048	136 aa		0.13	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	HSP30	P25619	332 aa		0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	AHT1	P29589	182 aa		0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	CAF4	P36130	643 aa		0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	NVJ1	P38881	321 aa		0.12	□□□□□ -2.39

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