RNA–Protein interactions for RNA: YPL194W

DDC1, Transcript of DNA damage checkpoint protein, yeast

Gene DDC1, Length 1,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDC1	YPL194W	STB1	P42845	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	NSE4	P43124	402 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	SNO3	P43544	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	WSC2	P53832	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	AHT1	P29589	182 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YKR073C	P36153	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	SKG1	P36169	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	ELC1	Q03071	99 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	SDH4	P37298	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YER188W	P40103	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	GEP7	P53171	287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YOL014W	Q08110	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	MCP1	Q12106	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	RSF2	P46974	1380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	MSA2	P36157	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	FIS1	P40515	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YFL019C	P43576	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YGL262W	P53054	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YNR062C	P53748	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TRP1	P00912	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	MRS4	P23500	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YJL028W	P47062	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	OSH6	Q02201	448 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	UPS1	Q05776	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	ATO3	Q12359	275 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	BET1	P22804	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TOD6	P34219	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	SHE1	P38200	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YHR130C	P38834	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	EAF6	P47128	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	PGU1	P47180	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	CLD1	P53264	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	NUP170	P38181	1502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	MOH1	P38191	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	OM14	P38325	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YAR029W	P39549	74 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	AVT6	P40074	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	MPM1	P40364	252 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	GAT4	P40569	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	PHS1	P40857	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	EST3	Q03096	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	MLP2	P40457	1679 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	GAA1	P39012	614 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	EMC4	P53073	190 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDC1	YPL194W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	ATR1	P13090	542 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	GTT1	P40582	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	SYS1	P41544	203 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	NCA3	P46955	337 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	BNS1	P50084	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	ATG5	Q12380	294 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	SGA1	P08019	549 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	RPB5	P20434	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	ATP15	P21306	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	COX10	P21592	462 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	SFT2	P38166	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	SAY1	P53324	424 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDC1	YPL194W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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